清代，“凌迟”并非正刑(不列入法典之中)，而是皇家的私刑。也就是说，凌迟只有皇帝才能下令执行，其他人是无权下令执行的，违者等同谋逆。
所以，曾国藩是无权决定李秀成是否受凌迟之刑。
当然，有专家称李秀成是曾国藩擅自下令杀害的。而曾国藩之所以要直接越过朝廷，那么急不可耐的，就擅自杀掉李秀成，是因为曾国藩为了邀功曾夸大和扭曲了很多关于太平天国的史实，他害怕朝廷在审讯李秀成时，从李秀成的口中得知真相，继而牵连自己，于是就不等朝廷指示，擅自将李秀成杀害。
这个说法，个人认为是不存在的。首先，在当时或投降，或被俘的太平天国将领，除李秀成外，还有誉王李瑞生、宗王谭乾元等人，这些将领也都是晚期太平天国的核心将领，他们也是知道太平天国的内幕的。因此，对于曾国藩而言，如若他真的是因为害怕自己夸大关于太平天国的事情，就擅自杀掉李秀成的话，他也必须要除掉誉王李瑞生、宗王谭乾元等人。可是事实上曾国藩并没有这么做，如宗王谭乾元就活得好好的。
其次，曾国藩是一个极其谨慎，也是十分懂得明哲保身的人，他绝对不可能冒着被群臣弹劾，被皇帝猜忌的威胁，去直接越过朝廷，擅自下令处置李秀成的。
李秀成如何处置，这并不是曾国藩能够擅自决定的。
身为太平天国晚期，最有影响力，也是最有威望的统兵将领，李秀成就是太平军的精神领袖，是一个可以举起反抗清军旗帜的领袖人物。李秀成的被俘，意味着太平天国再也没有东山再起的机会，清廷的胜利已成定局。因此，李秀成的被俘对于清廷是有着很重要的意义。
因此，此时清廷虽然将执行死刑的权力下放到地方督抚的手上，允许他们就地正法俘虏的太平军。但是，对于这么一位重要的人物，显然不是曾国藩能够擅自决定的，只有慈安、慈禧两位太后才能决定。
到这里，肯定会有人问，为什么清朝两宫太后不下令将李秀成凌迟处死呢?要知道，李秀成可是反贼，曾经是数次杀得清军溃不成军，占了清朝很多城池，搞得清廷是焦头烂额的，因此对于清廷而言，对李秀成这等谋大逆的太平军将领，对其处以凌迟是理所当然的事情。
可是，事实上，最后两宫太后并没有下令对李秀成处以凌迟之刑，那这到底是为何呢?
个人认为，两宫太后之所以没有对李秀成处以凌迟，其主要原因就是为安抚太平军。
首先，当时有很多投降清军的太平军，他们并未真正的臣服，清军对他们的掌控还是很薄弱。而这些投降清军，又没有彻底臣服的太平军，他们之中有很多都是十分敬重李秀成的。试想，如若他们得知李秀成居然被清廷下令凌迟处死，用酷刑去折磨李秀成，你说他们会怎样?有很大可能，他们会再次反叛，与清军誓死搏斗。
除此，此时太平天国虽覆灭已成定局，但是各地依旧有诸多继续负隅顽抗的太平军，对于这批残兵败将，清军依然需要格外的重视，一旦他们抱着必死的决心，与清军决一死战，清军还是有损失惨重的可能性的。如上文所说，李秀成在太平军是极具威望的，多数太平军对他都是很敬重的。因此，如若清廷用凌迟这样残酷的刑罚去对付李秀成，那些继续负隅顽抗的太平军绝对会群情激愤，与清军势不两立，定然是会用命去为李秀成报仇。若如此，清军必定会被重创，损失惨重。
由此，为了避免激怒这些太平军，清廷定然是不会太过折磨李秀成的，就算他必死，也会痛快的让他死，以此来避免激怒那些未投降，或以投降的太平军。
其次，除了为了安抚太平军的需要，还有一点就是李秀成投降后并没有负隅顽抗，更没有肆意的辱骂清廷。被俘后，李秀成是老老实实的将他所熟知的太平天国的秘书，告之朝廷。同时，李秀成也是诚心诚意的写下悔过书，让清廷昭告天下，并替清廷招降各地负隅顽抗的太平军。因此，对于两宫太后而言，李秀成虽必须死，但也算有功劳。如此，就是因这个功劳，李秀成算是彻底的逃过凌迟这一酷刑。
想想看，此时在各地就有诸多反抗清朝的太平军，如若清廷对待李秀成这位主动投降的太平军将领，是以凌迟的酷刑来对待的，试问以后谁还敢投降清廷?为了避免凌迟，那些继续负隅顽抗的太平军将领势必会誓死抵抗，不会再轻易投降清廷的。因此，为了给后面投降的太平军做一个表率，李秀成定然不会被太过残忍的对待的，毕竟在他们看来，身为核心人物的李秀成，也是的被处以斩立决，那他们这些不是很重要的太平军将领，自然就不会有更差的结局，是很大机会活命的。
总得说，清廷之所以不对李秀成处以凌迟，其主要原因就是为了安抚太平军，避免他们对清军产生更严重的敌视心理，同时也为后来的招抚太平军将领作出表率，让他们可以更加放心的投降清军，而不是继续负隅顽抗。