当《革命军》问世之际，《苏报》因章士钊接充主笔，于五月初六日(6月1日)宣布“大改良”，言论更趋向激进，“排满”、“仇满”的文词，连篇迭出。初六日刊登《康有为》一文，痛斥康有为力倡保皇、抵拒革命的言行。十四日(9日)，刊登《读〈革命军〉》，将该书誉为“诚今日国民教育之第一教科书”;又在“新书介绍”栏评论说，《革命军》“其宗旨专在驱除满族，光复中国，笔极犀利，文极沉痛。若能以此书普及四万万人之脑海，中国当兴也勃焉”。闰五月初五日(6月29日)以《康有为与觉罗君之关系》为题摘登章太炎《驳康有为书》，指斥“载湉小丑，未辨菽麦”，对康有为的保皇谬论痛加批驳。《苏报》迅即成为举国瞩目，独步一时的革命报刊。闰五月初五日、初六日，《苏报》馆帐房程吉甫和章太炎以及陈范的儿子陈仲彝、办事员钱宝仁等被捕。初七日(7月1日)，邹容自投捕房，以与章太炎共患难。蔡元培事前离沪赴青岛，陈范、黄宗仰、吴稚晖等避匿，旋出国远走。随后，领事团徇上海道的请求，于十三日将《苏报》封闭。
邹容自入狱起，即抱定为革命牺牲的决心。他同章太炎在狱中赋诗明志，互相砥砺。闰五月二十八日，章吟《狱中赠邹容》一首：“邹容吾小弟，被发下瀛洲。快剪刀除辫，干牛肉作糇。英雄一入狱，天地亦悲秋。临命宜掺手，乾坤只两头。”邹容即赋《狱中答西狩》相唱和：“我兄章枚叔，忧国心如焚。并世无知己，吾生苦不文。一朝沦地狱，何日扫妖氛!昨夜梦和尔，同兴革命军。”充分表现了革命者临危不惧，勇于献身，对前途充满信心的高尚情操和英雄气概。
不幸的是，邹容距出狱只有两个多月，即被折磨致病，于光绪三十一年二月二十九日(1905年4月3日)在狱中逝世，年仅20岁。噩耗传出，中国教育会立即为他开追悼会。遗骸由革命志士刘三(季平)冒险运出，安葬于上海华泾乡。南京临时政府成立后，经临时大总统孙中山批示：邹容“照陆军大将军阵亡例赐恤”。
邹容于1905年4月3日死于狱中，年仅21岁。其遗体由《中外日报》馆收殓后葬于华泾。辛亥革命胜利后，孙中山就任临时大总统，追授邹容为陆军大将军衔。后由华泾刘季平(刘三)移柩于华泾镇黄叶楼西侧(今华泾路中心河桥桥堍右侧200米处，近位育路口)。墓碑由蔡元培所题，为避清廷耳目，写为“周容之墓”。墓面南为圆形石砌墓，高2.36米，直径2.48米，墓前尖顶青石刻书“邹容之墓”。过神道石阶有石碑一座，刻有章太炎篆书“赠大将军巴县邹容”。墓后为章太炎撰文、于右任书的青石墓表。碑后复有造型美观的高大石屏，气势雄伟，东西两边各立一座石亭。在文革中被毁。1980年，为纪念辛亥革命70周年，上海市文物管理委员会重修邹容墓。墓区总占地一亩余，墓台座北朝南，面向大道，四周环有长青松柏，庄严肃穆，两边是正方形绿化区，广植花草。邹容墓现已整修一新，建成花园式陵园，向公众免费开放。