第二次世界大战接近尾声，苏联红军进攻在中国东北盘踞的关东军，在苏联的铁蹄下关东军死伤惨重， 731部队接到命令，销毁所有罪证撤离，之后他们就开始疯狂屠杀关押的百姓，销毁试验用具和机密文件，为了掩盖屠杀，他们将被杀的几百名百姓尸体堆到一起浇上汽油毁尸灭迹。
将一切罪证毁灭殆尽之后，在准备逃跑之际，731部队连同头目石井四郎一同被苏联红军包围俘虏，1946年远东军事法庭正式成立，苏维埃政府和中国政府要求审讯和宣判以石井四郎为首的731头目，然而还没等国际监察局将罪犯缉拿归案，美国竟插手此事。为了搞到731部队的实验资料，美国竟然与石井四郎进行了秘密交易。
美国情报部门向石井四郎和731部队军官表示，只要把研究成果交代出来，就可以一笔勾销在中国犯下的罪行，石井四郎知道自己不会被审判了，交代所有731的试验情况和报告。
美军机密部门于1947年向当时美国总司令麦克阿瑟发送的绝密电报表示：美国当局从美国安全保障的立场出发，不追究石井及其同伙的战犯责任。其理由是：“石井部队的资料是长时期的研究成果，是我们实验室里根本得不到的。”“731部队的细菌战资料对于美国的安全是极为重要的东西，其价值远远超过了用他们来揭发战犯”。
麦克阿瑟也十分清楚，如果审判石井四郎，日本作为细菌战的证据将被全世界知道。于是，麦克阿瑟下令将石井四郎等人隐匿起来，如果有人问起，一律下落不明。
1947年，美国得到了日本所有在中国展开的人体试验和细菌战的详细资料，石井四郎和731部队全体人员就此被免除战争罪行。美国从此将731和石井四郎他们包庇下来。而为了进一步在细菌武器上取得成果，美军把石井四郎和731的许多军官编入了美国秘密特种部队，继续研制细菌武器。
这个部门美国名义上是进行传染病研究，实则让石井四郎和731部队从操旧业，继续干上了细菌战研究的罪恶勾当。他们为美国整理了大部头的细菌研究报告书，近万张用人和动物进行细菌实验的幻灯片，大大促进了美国发展细菌武器的进程。
美国人的良苦用心终于有了施展的机会。1950年6月25日，朝鲜战争爆发，中朝两国人民并肩战斗，就在打的美国侵略者节节败退之时，为挽回败局，美军居然使用细菌武器，在朝鲜战场前线及中国东北上空大量散布沾满各种细菌的昆虫和食物。
那时是1952年1月，朝鲜已经进入了寒冬，但是抗美援朝还在焦急地进行着，1月27号，驻扎在朝鲜铁原郡的中国志愿军第42军阵地上空飞过几批美国飞机，他们低空盘旋，却没有像往常一样俯冲投弹，而是很快的飞走了。第二天早上，第375团的战士看到雪地上出现很多黑点在跳动，走进一看发现雪白的雪地里到处是黑乎乎的苍蝇跳蚤和蜘蛛。于是，42军立即写书面报告，送上昆虫标本，经过专家鉴定后，这些昆虫体内含有致命的细菌。
此次空投细菌武器共造成36名志愿军战士身亡。当时美国在辽东半岛各地也投下了大量如蚊子、老鼠等带细菌的昆虫，造成了大量民众感染伤亡。
731部队一个多么邪恶的部队，每一个中国人听到731部队无不愤怒，就解密报告显示731部队制造的细菌武器足以摧毁整个人类，但是就是这样却还有人逃避了正义的审判，他们虽然苟延残喘但是他们之中逃不过战争罪人的头衔，或许在另一个世界里，有很多“人”在等他们，很多很多，等待“审判”他们。逃避战争法庭的审判的石井四郎于1959年10月9日，患喉癌死于日本东京，虽然这个结果不公平，但是在“另一头”的审判一定是公平的。