清军的主要得失一是军事斗争与外交斗争相互配合，斗争有理、有利、有节。面对沙俄军队对中国黑龙江流域的不断侵略和蚕食，康熙帝本着先礼后兵的原则，曾多次与沙俄进行交涉，坚决要求沙俄军队停止侵略行径。当外交手段未能奏效时，才使用武力驱逐入侵者。
待军事上取得胜利之后，又通过外交手段来巩固军事斗争的胜利成果，使这场捍卫领土主权的斗争开展得有理有利有节，最终使沙俄不得不撤出雅克萨，承认中国在黑龙江流域的领土主权。由于这场斗争的性质是正义的，因而得到了黑龙江流域地区各族人民的大力支持，军民同仇敌忾，士气高昂，为战争的胜利提供了可靠的保障。
二是善于把握战机。沙俄侵占雅克萨，正是清廷忙于平定三藩之乱，无暇顾他之时，于是康熙帝暂时放弃使用武力，转而采取外交手段解决。待三藩平定后第2年，康熙帝即将以武力驱逐沙俄侵略者的问题提上议程，并在做好充分准备的基础上，先后两次出兵雅克萨，对入侵者给予了严厉的惩罚。后来卫拉特蒙古准噶尔部首领噶尔丹发动叛乱，清廷为避免两面作战，及时与沙俄签订了《中俄尼布楚条约》，从而结束了战争，以便有精力对付噶尔丹叛乱。
三是作战中善于扬长避短。清军根据侵占雅克萨的沙俄军队城坚炮利、但人数较少的特点，以及清军火器较弱，但人数较多的情况，主动扬长避短，不急于在敌炮火下发动强攻，而是在城周围挖壕，断其外援，作长期围困，使其炮火优势无从发挥，1年后粮弹消耗殆尽，因饿、病和作战而死者占90%以上。沙沙俄侵略军虽然选择了清朝三藩之乱的有利时机侵占雅克萨，而且又有城坚炮利等军事优势，但由于他们所进行的战争是非正义的侵略战争，因而遭到当地人民坚决反抗，加之沙俄侵略军入侵战线拉得过长，补给和后援都难于保障，很快就陷于四面楚歌的境地，失败也就成为其在所难免的结局。
雅克萨之战是中国清代对外战争的一次重大胜利，以下是大学教科书《中国古代史(下)》某版本的原文节选：
“雅克萨反击战... 在沙俄军队遭受重创、守城士兵只残存几十人、雅克萨城旦夕可下的情况下，沙俄被迫同意和谈。清康熙二十八年，中俄双方于尼布楚正式谈判。鉴于当时西北地区准噶尔部噶尔丹配合沙俄侵扰喀尔喀蒙古，割据叛乱势力十分猖獗，为避免两线作战，集中精力平定准噶尔，康熙指示谈判代表做出让步。而俄罗斯因军事上未能得逞，加上远征克里米亚失败，战线过长，竭力想保持既得侵略权益，也不得不做出相应妥协。双方签订《中俄尼布楚条约》，规定两国东段边界以格尔必齐河、外兴安岭和额尔古纳河为分界线，从法律上肯定了黑龙江流域和乌苏里江流域广大地区属于中国领土，拆除俄国在雅克萨和额尔古纳河南岸修筑的据点，撤出侵入的军队。清前期签订的中俄条约属于平等条约，具有重大的历史意义。”