另一个被朱元璋兔死狗烹的是刘基，这个传说中能呼风唤雨、神通广大、和诸葛亮齐名的人物，在朱元璋夺取天下的过程中功劳可谓最大。一次，刘基要儿子奏请朝廷在一处私盐贩子聚集、元朝时便有人造反的地儿设巡检司防守，以防动乱，结果被宰相胡惟庸进谗言说刘基“看中了那块地有王气”，想在那里筑坟，将来自己的子孙就可以称王称帝。朱元璋当时的心理活动我们不好乱说，但是此君绝对不是一个糊涂昏庸之人，如果刘基想称王称帝，又为何出山辅佐他朱某人？
但朱元璋的原则是，宁可信其有不可信其无，宁可枉杀千人勿使一人漏网。一代奇人刘伯温就这么被朱元璋诛杀。再来看看一代名将徐达的下场。战功赫赫的徐达是被朱元璋在称帝后仍称呼为兄的功臣。话说徐达背上长了背疽，在京城养病，医生特别嘱咐背疽不能吃鹅肉，否则性命不保。听闻此言，朱元璋专门从皇宫给徐达送了一只烤鹅。
事实上，朱元璋对曾一起出生入死的忠臣元勋实行的是灭种式的屠杀。在明初两大谋反案“胡惟庸案”与“蓝玉案”中，各路开国功臣被以各种各样的形式和罪名牵连，几乎被一网打尽，甚至株连九族。
但是，单凭两人残忍诛杀功臣良友一事就判断二人丧尽天良、心理变态，似乎又有失公允，这两个人，其实是白眼狼+灰太郎，对待兄弟一个态度，对待老婆孩子则完全相反。刘邦后期虽然不喜欢发妻吕雉，但总是保留着其皇后的身份从始到终，而朱元璋和马皇后的故事更是传为美谈。
另外，两人大肆诛杀功臣的一个重要原因，就是为子孙计。
有时候眼见着儿子不够聪明难成大器，当爹的就不得不趁着有生之年将障碍为其一一铲除。比如关于朱元璋疯狂屠杀功臣元勋的原因，史学家有一种解释是，朱元璋看到皇太子懦弱，担心他死后自己这些能人兄弟们强臣压主，所以先下手为强。
并且有一则宫廷逸闻可为佐证：有一天皇太子劝说父皇不要杀人太多，朱元璋怒了，把一根长满了刺的棍子丢在地上，命他用手拾起来。皇太子抓住刺棍，结果给扎破了手掌。朱元璋说，儿啊，爹是事先为你拔掉棍上的毒刺，你难道不明白我的苦心吗？