或许是瓦剌人的阴谋，总之，明英宗归国后，大明帝国变得很不安宁。昔日的皇帝成了上皇，昔日的郕王成了今上，现实如此残酷而惊喜。一山不容二虎，对于明英宗朱祁镇的归来，明代宗朱祁钰很不情愿，主要原因就是担心明英宗复辟，抢回原本属于他的皇位。为此，明代宗不得不狠下心来，将明英宗软禁在了南宫。
太上皇帝，无非就是个耀眼而又惨淡的角色，有名无实，有位无权，没他不少，有他则多。在明代宗看来，明英宗活着回来，就已经对他的皇位构成了威胁;只要明英宗还活着，他就睡不踏实。毕竟，明英宗之前在位十四年，根深蒂固，虽然失位，但其影响力还在，那一班老旧官员还有效忠前主的意愿;他们认为，“太上出狩，非为游畋，为国家耳”，以至于“天下人心向幕不衰”。
明代宗并非多心，也并非以小人之心度君子之腹。皇权至高无上，谁人不觊觎?就连鸠占鹊巢的明代宗本人，在坐上皇位一年后，在面临迎回上皇的尴尬问题时，也曾说“朕本不欲登大位，当时见推，实出卿等”，言语中流露出了对皇位的眷恋和对明英宗归国的抵触，直到手握军权的于谦一语定乾坤，说出“天位已定，宁复有他”的话，表示力挺当今皇帝，明代宗这才放下心来。明代宗如此，那么一个当了十四年皇帝的人，因为变故一下子失去权势，明英宗能甘心吗?
皇位有了新主人，且既成事实，明代宗又不肯让位，明英宗很无奈，但没有办法。不过还好，自己的儿子朱见深为太子，明代宗死后，皇位最终还会传至自家，明英宗虽不甘心，但为了儿子，他还能忍气吞声，而明代宗对他却像防贼一样，唯恐他借助太子的影响力复辟。两年后，也就是景泰三年(1452年)五月，明代宗玩了一手绝的，即废掉朱见深，改立自己的儿子朱见济为太子。消息传到南宫，明英宗未免恼怒，复辟之心顿起，为此也做出了一些动作。
当时，南宫有一名太监，名叫阮浪。为了复辟，明英宗将随身的一个镀金绣袋和一把束刀赏赐给了阮浪，目的是让他以此为信物，悄悄与外界取得联系。阮浪不负所托，将明英宗的信物转送给了门下一名叫王尧的太监，王尧前往卢沟桥后，行事不谨慎，被锦衣卫指挥卢忠察觉，于是“进酒醉之，解其袋刀入告变，谓南宫谋复皇储，遗刀求外应”。明代宗大怒，在杀掉了阮浪、王尧后，“犹欲穷治不已”。此后。明代宗明显加强了对明英宗的监管，南宫大门上锁灌铅，南宫附近树木砍伐殆尽，加派锦衣卫昼夜巡防，只留下一个小洞传送食物。
明代宗认为，明英宗被困住了，太子也换了，这样就万无一失了。然而，到了次年(1453年)十一月，太子朱见济病死，明代宗又没有其他儿子，国本又成了帝国大问题。一时间，群臣建议重新立朱见深为太子的呼声很高，甚至有人建议明代宗重新尊崇明英宗，给予政治上的优待，“太上皇帝君临天下十四年，……是天下之父也。陛下宜率群臣每月朔望及岁时节旦，朝见于廷安门，以极尊崇之道”，结果遭到明代宗的摧残迫害，“下锦衣狱鞫讯，体无完肤”。
接下来的几年，明代宗卯足了劲，仍未能生出儿子。景泰七年(1456年)十二月，明代宗病重，“以储位未定，中外忧惧”，册立太子的事情再次被群臣提起。当时，明代宗有三种选择，其一，立外藩为太子，外藩必感激涕零，这样他身后的名号、牌位、祭祀都没问题;其二，重立朱见深为太子，朱见深在太子地位失而复得后，日后为君也会感激他这个叔叔;其三，让位明英宗，明英宗复辟后难免会对他进行清算报复，这是明代宗最不情愿也最难以接受的。
选择一或二，杜绝三，是明代宗病重时亟待解决的大事。然而，明代宗优柔寡断，未能实施。身犯病重，又在身后问题上犹豫不决，不少大臣对明代宗有了看法，也让有心建立“不世之功”的石亨、徐有贞、曹吉祥等人以及有着强烈复辟意愿的明英宗有了武装夺权的机会。景泰八年(1457年)正月十六日晚，石亨等人发动“夺门之变”，次日凌晨，明英宗成功复辟，“鸣钟鼓”，宣告重新登位。当时，明代宗“方病卧，闻钟声，问左右为谁。既知为上皇，连声曰：好!好!”(《明通鉴》)
怕什么，来什么，明代宗防了明英宗近七年，最终还是没防住。当断不断，必受其乱!此情此境，明代宗说出这两个字，内心极其复杂，涵义也极其复杂，应该说，这既是大势已去的失落，又是无可奈何的叹息。总之，明英宗复辟，对明代宗来说，是他三种选择中的下策，也是最坏的消息。对明英宗禁而不杀的妇人之仁，让明代宗付出了惨痛代价，帝号被废，被人勒死，寿陵被毁，痛斥其“不孝、不悌、不仁、不义，秽往彰闻，神人共愤”，谥号“戾”。明宪宗朱见深即位后，改追谥号“恭仁康定景皇帝”，字数虽少，但毕竟承认了他是皇帝;直到南明弘光时期，明代宗才有了庙号，代宗