卜弥格出身望族，父亲是波兰国王的御医，他家学很好，对医学有很深的研究。1643年，他离开里斯本前往东方——当时来华的传教士，都必须从里斯本出发，因为当时的东方护教权是由葡萄牙负责的，往大西洋、往美洲是由西班牙负责的。1644年卜弥格来到澳门，学习了汉语，1647年到海南岛去传教。
1644年北京的明朝政权覆亡之后，南方又拥立了一个小朝廷南明王朝，最后一个皇帝是永历皇帝。当时局势十分危险，1651年永历皇帝决定派遣卜弥格作为南明王朝的特使返回欧洲，向罗马教廷求救。当时罗马教廷仍然是欧洲很重要的一个力量。现在看起来这是一个非常可笑的事，南明王朝危机了，跑到几万里之外的罗马去搬兵——但正是这么一个活动，促使了中国与欧洲的第一次正式的外交接触，很多人说中国与西方世界的接触是康熙年间的《尼布楚条约》，实际上在这之前就有卜弥格出使罗马。
卜弥格回到罗马，非常不受重视，因为明清鼎革的局势很复杂，耶稣会对中国的政治判断也非常狡猾。当时中国有三个政权——清朝、南明王朝，张献忠的部队也还没有完全被打败。张献忠地盘上有两个传教士，安文思和利类思;清军进关以后在北京留下的有汤若望;随着南明王朝南迁的两个传教士，是瞿微纱(AndréKoffler，为清兵所杀)和卜弥格。耶稣会派了卫匡国(MartinMartini)回到欧洲告诉梵蒂冈，说卜弥格代表的南明王朝基本上完了，所以梵蒂冈一直不接见他，拖了他整整三年多。他穿着明朝的衣服几次要求觐见，最后教廷还是礼节性地见了他，把他打发走了。当时他带回西方的一些材料，全部放在罗马的耶稣会档案馆。
卜弥格1656年离开了欧洲，带着当时的教宗给永历皇帝的母亲王太后和太监庞天寿的信回中国。1658年他到了澳门，很倒霉，当时清军已经完全占领了广州，澳门当局害怕接待这位南明特使后，清兵对澳门不利，就拒绝他进入澳门。他没办法只好又返回安南(现在的越南)，希望从陆路回到中国。他一路劳顿，终于病倒，就病死在越南和广西的边界线上。他一生都是在为南明王朝服务。他走的时候带了两个小修士，其中一个叫陈安德，一直跟着他，最后把他草草地埋在了中越边界线上。