清华学堂在教学上“所有办法均照美国学堂”，但在行政管理上还是封建王朝的一套。清华校名全称是“帝国清华学堂”，英文校印用“Tsing Hua Imperial College”。那时的学生，嘴里讲的是洋文，脑后却拖着长长的辫子。学堂设西学部和国文部，西学部采用西学教材。建校之初，清政府外务部就由美国青年会(YMCA)推荐聘请教师来清华任教。宣统二年正月(1911年2月)，共有17名美籍教师(男8人、女9人。一说为18人)到校执教，他们也是清华第一批外籍教师。美籍教师承担西学部大部分教学工作，中等科课程主要是英语训练，高等科则是学习美国大学自然科学、社会科学和人文科学的基础课程，课程中渗透着美国的影响。
“学堂监督”下设三“长”。教务长胡敦复负责教务管理;庶务长唐孟伦负责庶务管理;斋务长陈筱田(生卒年不详，天津人)负责学生管理。庶务长除校园建设外，还主管会计处，负责全校的财务工作，包括校内办学经费和国外留学经费。另外，后勤工作大都归庶务长管辖，诸如管理学生食堂、成立校卫队负责校内治安和保卫、经营园内木厂、成衣店、书店、鞋店、理发店、牛奶房、洗衣房等生活设施等等。此时学生入学后所花费用不多，学宿膳费免交，一个学期只交体育费1元，以及预交期终可退还的赔偿费5元，7元钱一月的伙食(相当于当时一个工人的月薪)。
斋务长严格管制学生的一举一动。学生未得许可，不得擅自离校;不准饮酒吸烟;每周至少洗澡一次;身上不许带钱，不许看“闲书”，早晨7点起床，必须于7点20分准时到食堂吃早饭等等。斋务处制定了奖惩规定：奖励有物质和名誉奖;惩罚按情节分训诫、思过、记过、开除等。思过房间内地势低洼，冬天冷夏天潮，室内空无所有，旁边还有斋务处人员监督。学生一进入思过室，就有进入监狱的感觉。
1915年入学的梁实秋(1903—1987，祖籍浙江余杭，生于北京)回忆道：
“事后想想像陈筱田先生所执行的那一套管理方法，究竟是利多弊少，许多做人做事的道理，本来是应该在幼小的时候就要认识。许多自然主义的教育信仰者，以为儿童的个性应该任其自由发展，否则受了摧残以后，便不得伸展自如。至少我个人觉得我的个性没有受到压抑以至于以后不能充分发展。”
清华学堂以“培植全材，增进国力”为宗旨，以“进德修业，自强不息”为教育方针。学堂曾被称作“国耻学校”，一代代清华学子感同身受，牢记国耻，作为中国有志青年更增添一份爱国情怀，发愤自强，追求真理。
学堂虽属初创，但各方面的规章制度都已制订出来了。在这宁静的清华园里，学生们都非常用功。学堂正慢慢走向正轨。(摘自李子迟等人著《清华百年演义》一书，济南出版社出版)