根据她手下的太监李莲英所说，光是在她头上所戴凤冠的硕大珍珠，就价值一千万两白银。除此之外，各种翡翠制成的水果蔬菜、莲花雕塑，不计其数。就是这样的一笔让人惊叹的财富埋葬在她的地宫之中，恰又适逢天下打乱，她的陵寝就犹如一块巨大的蛋糕，那些饿极了的兵匪，又有几个会不动心呢？
就在她死后的二十年后，1928年，她的陵墓被人强行打开，一伙以保护陵寝为名的国民党军队，炸开了陵墓的入口，对藏于其中的财宝，开始大肆掠夺。其中为首的就是那位恶贯满盈的孙殿英，他先后盗掘了慈禧和乾隆两人的陵寝，而这也恰恰是清朝藏宝数量最多的两座陵寝。
无数的财宝让人发疯。早在进墓之初，孙殿英就明令禁止肆意抢掠，而是等到将宝物尽皆取出后再分赃。但那些许久没有见到军饷的士兵，犹如饿疯了的恶狼，进入陵墓后，就开始疯狂的抢掠。嘴里的宝珠被人扣走不说，脸也在扣宝珠的过程，被人扣得面目全非，后来还被人扒光了衣服，仅剩一条内裤遮挡私处，接着又被人从棺椁中抛出，模样惨不忍睹。
盗宝时间发生40多天之后，以溥仪为代表的大清后人，这才急匆匆的赶到地宫中，着手将其重新安葬。当时他们看到慈禧的遗体被人丢弃在了棺椁之上，体表浮现无数斑点，还生出了一层白毛。
此时大清已经名存实亡，他们无法再将其隆重的重葬，见当时的内棺尚还可用，便顺势将其重新殓入棺中。不过这一次和上一次的规格比起来，却是天差地别，简单的安葬后，他们将棺口用漆封住。
此时棺椁之中再无值钱的事物，盗墓者们自然也就对其没什么兴趣，此后的五十余年里，慈禧再没有受到外人的惊扰。
直到1984年，由我国的文物局专家小组，对慈禧内棺展开了专业的清理行动，专家们依次检查了她的遗体和二次入殓的陪葬物件，进行详细的记录后，再用防腐药水喷洒在其体表，接着按照原样抬回了棺中，待等到所有物件都恢复到之前的模样后，又进行了第二次的药水喷洒。
随后专家们将内棺重新封好，然后由木工们将外椁修复完毕，重新套在了内棺的外面。至此清理行动就此结束，慈禧的一生才终于尘埃落定。