如此安排，除了谨慎之外，也暗藏了日本的心机——刘仁轨将军是大唐中央政府在地方上的军政首脑，他所派出的使团就只能代表百济地方，如果日本接受了这种外交模式，就等于认同本国与大唐熊津都督府处于同一个外交等级之上，从而就失去了直接与大唐中央政府对话的资格。
尽管唐朝并未对日本采取进一步武力行动，日本国内却爆发了“壬申之乱”,大海人皇子取得了最后的胜利，为后来登基为天武天皇打下了基础。这位执政者把主要精力用在内政改革之上。
天武天皇即位之后，受到大唐高宗皇帝自称“天皇”的影响，决定将称号也使用汉字中的“天皇”二字，又将国号正式改为“日本”。“日本天皇”这个特定称呼正式登上日本历史舞台。
白江口战败，使日本深刻认识到本国与唐朝综合国力的巨大差距，也意识到自己从老师那里学到的东西还远远不够，此后，日本的学习欲望和动力非但没有减弱，反而更加强烈。