公元前218年，百越军在首领桀骏的领导下，朝着疲惫不堪的秦朝军队发动了反击，不仅杀掉了秦军将领屠睢，更让后者损失了三十万左右的士兵。在血流成河的反击战后，秦朝余下来的二十万大军只能撤退到广东、广西的北部地区。当然，百越军队也付出了非常惨重的代价。于是，双方保持了近四年的对峙关系。
公元前214年，基于灵渠粮道的全面畅通，秦始皇再次发动了三十万大军，而另一边的百越军队，此时只剩下不到一万人的武装力量。于是，这场战争胜利的天平彻底倒向了大秦帝国。在没有遇到像样的抵抗后，秦朝军队彻底拿下了岭南地区，并规划了南海、桂林、象郡等三郡。
最后，总的来说，这场大秦帝国和南方百越民族的战争，最终以秦始皇的胜利而告终。经此一役，整个中国的基本疆域得到进一步完善，两广地区成为中国统治区域的一部分。值得注意的是，秦朝末年的时候，南越国一度独立了出来，甚至在汉朝初年击退了汉高祖刘邦的入侵。不过，在汉文帝时期，整个南越还是彻底归顺了大汉王朝。至此以后，两广地区再也没有和中原王朝失去联系。