清军曾与英国人、葡萄牙人组成联合军，对红旗帮进行讨伐，郑石氏亲自坐镇大屿山指挥，采用围魏救赵的的计谋，派主力袭击广州城，杀掉总兵。使得联合战队不得已撤退，在途中又遭红旗帮的包围，最后狼狈落败而逃。
后来，在强攻不行的情况下，清廷对沿海匪目实施怀柔政策，在其他海盗接受招安并获得不错安置的情况下，郑石氏或许也早已厌倦浮舟泛海、打杀劫掠的生活，于是放出风声愿意归降。就这样，官家与海盗双方进行谈判后，在嘉庆十五年，郑石氏率众归降，政府接收了红旗帮“大船二百七十只、部众一万六千、妇孺五千、刀矛七千、火炮一千二百门”。
从这份历史记载的清单看，郑石氏的红旗帮堪称史上最强悍的海盗队伍，更何况这还不是全部，因为在得到郑石氏接受招安消息后，红旗帮出现分裂，大多数人不愿归降，并留在香港等地继续操持旧业。归降之后的郑石氏，据传在晚年曾协助林则徐抗击英国入侵者。
不得不提的是，当时帮内还有一位叫做张保仔的人物，他小时候以娈童身份被郑一俘获，郑一死后，因其精明能干，对郑石氏言听计从，深获信任，史书记载二人关系为“名为主仆，暗为夫妻”。
郑石氏作为一女子，在一直庞大的海盗队伍中站稳脚跟，不可不谓奇女子。近年风靡一时的《加勒比海盗》中有一东方面孔的女性海盗清夫人这一角色据说是根据郑石氏为原型塑造的。