皇太极死后，因为是突然猝死，因此没有留下遗嘱，指定继承人。多尔衮所在正白旗和豪格所领正黄旗，两方对峙，互相争权夺位，甚至最后差点发展为兵戎相见。在这样僵持不下的时候，两方各退一步，相互妥协，将年皇太极的第九个儿子，年仅6岁的福临退出来继位。年幼的君主，自然没有多少实权，实际上操控整个帝国的一直都是多尔衮这个摄政王。
多尔衮领兵与明军作战，实现了皇太极生前所想，攻破明关，入主中原。随着军功越是显著，多尔衮手上的权势也就越大，他一路从摄政王，到叔父摄政王，再到皇叔父摄政王，最后坐到皇父摄政王的位置，可以说位同皇上。这样一个权势滔天，功绩显著，声名赫赫的男人，最后却落的个死后清算，甚至传闻还被顺治帝鞭尸的结果。那么这位一手奠定了清王朝地位的人，他死的真的这么惨吗?他真的被他扶上位的顺治帝鞭尸了吗?
随着权势越大，多尔衮身边周围阿谀奉承的人也就越多。”无成谋，拥戴者駸駸，骑虎难下。“，由此可见，多尔衮在周围人的奉承下，定是将自己摆在皇帝的位置，而不将顺治帝看在眼里。传言顺治帝小的时候，多尔衮根本不让他接受教育，一心想把他养废。再加上多尔衮和孝庄之间的流言蜚语，说顺治帝憎恨多尔衮，想要将他挫骨扬灰也不是无中生有的。
另外许多史籍上对多尔衮有没有被鞭尸，实际上是有记载的。意大利传教士卫匡国在《鞑靼战纪》中记载说：”顺治帝福临命令毁掉阿玛王(多尔衮)华丽的陵墓，他们把尸体挖出来，用棍子打，又用鞭子抽，最后砍掉脑袋，暴尸示众，他的雄伟壮丽的陵墓化为尘土。“而多尔衮坟墓中，金银珠宝全无，只有一个象征性的尸棺也是一个佐证。
再有浙江海盐人彭孙贻在《客舍偶闻》中：”“墨勒根王(多尔衮)初称摄政，次称皇父，继而称圣旨。王即无成谋，拥戴者駸駸，骑虎难下。”，又说他：“焚王骨扬灰，世祖始克亲政”。
彭孙贻写《客舍偶闻》的时候，正是这件事发生的十年后，当时他在京中一位姓查的官员家中小住，应该说彭孙贻说的“焚王骨扬灰”这件事，应该是真的。
所以多尔衮因为得罪顺治过狠，以至于在他死后两个月，以其为首的集团就被群起而攻之的大臣们弄的土崩瓦解，他自己也被顺治帝清算，甚至还被鞭尸。
多尔衮虽然一生纵欲贪色，有记载在录的妻妾就有十几位，其他未记载的朝鲜族和汉家女子更是多不胜数。但他一生却只生了一个女儿，还是和朝鲜女人生的。他女儿名叫爱新觉罗·东莪，多尔衮亲生独生女，生母为继妃朝鲜李氏。
据说其名东莪为多尔衮为纪念同父异母姐妹东果格格而取。多尔衮还有一个养子，爱新觉罗·多尔博，是过继的他弟弟多铎的儿子。多尔衮死后遭清算，养子多尔博被革归宗，继承的爵位也被削除。而多尔衮的亲生女东娥，被过给了信王，此后的下落不详。
多尔衮一生娶了那么多女人，却只留下了东娥这一个亲生血脉。据说是因为多尔衮体弱多病，再加上早些年四处征战，落下了病根，因此不易有孕。