明朝这个时代很有意思，自太祖建国以后就屡屡受到倭寇侵扰，到了嘉靖时期更是达到了高潮，一直到了明朝快灭亡的时候才慢慢消失，那么问题来了，元朝和清朝怎么就没有倭寇，难道明朝就好欺负?要了解这其中的问题，就不免要梳理一下日本当时的政治环境了。
日本南北朝时期
明朝建国是在1368年，而日本自1336年起内部开始分裂，出现了南朝和北朝，北朝以京都为政治中心，，南朝以吉野为政治中心，同时出现了两个天皇。这种南北对峙现象一直持续到了1392年，南朝实在是混不下去了就投降了北朝。
日本的天皇在明治维新以前是没有实权的，真正掌握着实权的是将军，当时的将军叫征夷大将军，设幕府来管理事务，和中国某些朝代一样，日本当时也有很多的诸侯叫地方封建领主，势力都很强大，有很多的地方割据势力幕府不能掌握，这些地方的封建领主有大量的庄田以及军事力量，他们不完全服从幕府的命令，不向中央交税，这样一来幕府的财政就很困难。
封建领主占有大量的土地，下面大量的武士却得不到土地，生活困难，于是他们就到海上去抢劫，从沿海一直到明朝的海疆，慢慢的就成为了倭寇。
日本的内战年代
由于经济困难，手里没钱的幕府提出了和明朝通商。明朝政府是欢迎和日本通商的，但是明朝政府不了解当时的日本国内的政治情况，作为政治条件提出了让幕府在国内镇压这批倭寇，于是幕府和当地的封建领主便出现了矛盾，日本从此便陷入了100多年的内战，大概是从1467-1573年，此时的日本处于“战国时代”，在明朝后期，倭寇的侵略就更加的严重了。
明初，在沿海地区成立了“市舶司”，设立了广州、宁波和泉州三个通商口岸，外国人可以自由的在三个港口做买卖，那么在明朝政府内部就出现了一种声音，认为就是通商才招来了倭寇的抢劫，应该关闭市舶司，这种论调在当时很有市场，最终在1523年，嘉靖二年关闭了市舶司。
但是关闭市舶司就出现一个棘手的问题
原来沿海的居民由于土地的兼并，很多人都和外国人做点小生意，而当地的地主阶级为了赚钱也有自己的船队，其中有个很有名的商人就是沈万三，他们把明朝各地的物产通过海运卖给了外国商人，市舶司关闭以后，这些人赖以为生的手段就不合法了，生活就困难了，于是他们有的就铤而走险与外商做生意，有的就与海盗勾结合作，抢劫，慢慢就形成了一批明朝的海盗。
明朝的海禁几次开放而又关闭，形成了一个独特的现象，开放时各种商人正常贸易，称为海商，关闭时，偷偷交易沦为海盗。
十六世纪初，葡萄牙人来到了东方，这些葡萄牙人一方面进行通商活动，另一方面又从事海盗活动，不但进行海盗活动，还占据了我们福建沿海的一些岛屿。
那么倭寇的群体便有日本人、中国海盗和葡萄牙人组成了，这些利益群体通过合作已经形成了很强的力量，更有些沿海官员，为了抗倭政绩，把当时的内陆地区的乱民和罪犯也充为倭寇，所以此时被称为倭寇已不仅仅是日本人了。
凭借大明的军力倭寇为什么就是打不退?
明朝的中后期，倭寇最为猖獗，浙江宁波一带受害最严重，政府也派了官员总管浙江、福建两省的军事，有个有名的官员叫“朱纨”，他坚决抗击倭寇海盗，杀了一大批倭寇、葡萄牙人还有海盗，海盗中间就有很多是明朝的人，这样一来，就引起了轩然大波，被杀的这些人里面，有一些就是沿海的大地主们派出去的，这样一来那些大地主在京城的代言人就开始反对朱纨，说他错杀良民，朱纨就被撤了，最后落得了自杀的结果。
朱纨死了以后，倭寇的问题还是没有解决，情况甚至更严重了，倭寇长驱直入，不但江苏、浙江、福建的许多城市，连农村也遭到烧杀、抢劫，倭寇甚至还打到了南京城下，打到了苏州、扬州一带。而此时明朝的军队已经是彻底的腐化了，没有战斗力，一小波倭寇便能长驱直入，杀入大明朝的腹地，正在此时挽救大明朝危局的两个人出现了，他们便是戚继光和俞大猷，经过十年左右的努力，彻底解决了倭寇的问题。
倭寇解决了，新的问题有来了，此时日本的政治局面又发生了变化，原来的幕府被推翻了，一个叫丰成秀吉的人军事统一了日本，但他也不能完全控制封建领主，为了巩固自己的统治，丰成秀吉发动了侵略朝鲜的战争，明朝政府在朝鲜的要求下派兵救援，这场仗打了7年，直到1598年丰臣秀吉病死，战争结束。
清初，日本和政府建立的良好的关系，国内政治局面也稳定了，倭寇就退出了历史的舞台。