中央军主要有四大主力，其中关中军团以旧秦国军队为基础，是帝国军队真正的精英(也有学者认为正卒专指这只军队)。另外三支军队根据其特点，姑且分别命名为长城军团，骊山军团，岭南军团。这几只军团(尤其是关中军团)的命运决定着帝国的命运。
一、岭南军团的去向：岭南军团的统帅从屠雎到赵佗战绩都并不算太出彩，这只军队平定岭南地区后，即在当地驻扎。后来在秦末战乱时，封锁了五岭边界，没有参与和影响中原战事。
需要说明的是，第一，这只军队的数量不可能达到50万，史记没有明确记载这只军队的数量，50万的来源是《淮南子》，钱穆认为此书一向酷爱信口开河，严谨性可疑。就岭南的战略地位而言，皇帝陛下砸下五十万的军队实在有点天方夜谭(想想看当年伐楚出六十万军队皇帝陛下就心疼的要死)，如今历史学界大多采信十万左右的数字。估计将军队，移民，徭役，运输的人数加在一起可能有五十万。
秦朝疆域范围
第二，这只军队的素质应当为四大主力最差，因其主要是以步兵(材官)和水兵(楼船士)为主，几乎没有骑兵和车兵，所面对的对手主要是岭南的部落酋长的武装力量，但战绩却乏善可陈。
第三，这只军队之所以在秦末战乱时选择独立，并非一开始就是对帝国政府不怀忠心，而欲独立，很可能是因为紧靠岭南的东南地区原为楚国故地，在秦末动乱时为反叛最为严重剧烈的地区，而岭南军团权衡两方实力而不愿受东南地区叛乱波及，危及自身，故在战略上作出了自保的决定。
二、长城军团的去向：长城军团是帝国北方边境的勇士长城，秦末战乱前沿长城布防以抗匈奴，平心而论，除开关中军团，长城军团实为帝国最精锐的部队，所部多有骑马控弦之士，相当一部分军队也是以老秦国军队为基础并且久经战阵。数量在最多时据史记记载达三十万，秦末战乱时在二十万上下。长城军团战绩显赫，始皇帝三十二年，蒙恬率三十万大军北伐匈奴不到一年的时间击退匈奴七百多里，夺取匈奴内蒙古河套地区，屯兵于榆林。此时离秦末战乱还不到四年。
秦末动乱发生后，长城军团第二任统帅王离(即王翦之孙)奉命领军南下平叛，长城军渡过黄河进入雁门关太原地区，后主要在燕赵旧地作战，先是在赵国叛将李良的配合下攻灭了武臣的赵国政权，后赵歇在齐国支持下重建赵国，长城军团的对手变成齐赵联军。公元前208年九月，长城军团一部分人秘密南渡黄河，与濮阳骊山军团联合，于定陶击败楚军，并杀死将军项梁。不过这已经是长城军团最后的辉煌了。
次年，长城军团围困齐赵联军与巨鹿，眼看骊山援军即将赶来，巨鹿破城在即，未料到项羽抢先一步破釜沉舟渡过漳河，切断了长城军团与骊山军团的联系，并在巨鹿城下给予师老兵疲的长城军团致命一击，最终主帅王离被俘虏，两位副帅一位战死，一位自杀，长城军团大部覆没，余部溃散。长城军团没落的最主要原因，在于缺少真正的帅才(比起蒙恬还有自己的爷爷，父亲，王离只能算是庸才)和运气不好(在当时任谁也想不到会杀出项羽这么一个二愣子)。
三、骊山军团的去向：骊山军团是秦末战乱中新建的军团，数量大概在二十万上下，主帅是章邯。骊山军团取得了帝国平乱战争的最大胜利，也一手造就了平叛战争的最大失败，真可谓功首罪魁非两人，遗臭流芳本一身。
骊山军团于秦二世二年初编成，主体是关中地区的农民以及骊山刑徒，武器装备直接取自武库，骊山军团的编成由关中军团直接监督，可能也有一部分为关中军团成员，尽管史记记载骊山军团都是骊山刑徒，但是综合秦朝当时的实际情况及后来的研究成果，全部为骊山刑徒的可能性不大，骊山军团于二世二年初同关中军团击溃周章军并杀周章，继而出关于十二月攻陷张楚首都陈县，并消灭陈胜军主力，陈胜于城父被车夫所杀。
骊山灵泉美景
再之后，在不到一年的时间内，骊山军团要一鼓作气，进入旧魏国地区，攻克魏国首都临济，平定魏国地区的叛乱，击败增援魏国的齐楚联军，杀死魏王田儋，二世二年九月，骊山军团会和长城军团于定陶击败楚军，杀死项梁，取得了平叛的最大胜利。
二世三年初，骊山军团几乎扑灭了黄河南岸的所有叛军，并渡过黄河，攻占旧赵国首都邯郸并围困赵王于巨鹿。骊山军团本准备配合长城军团围点打援，消灭六国援军。