关于袁崇焕的评价，明史已有定论，在金庸的渲染下，人们普遍认为袁崇焕袁督师尽忠报国，枉死于后金的反间计。但灰熊猫的《窃明》一书中却提出了完全相反的观点，他认为袁崇焕是一个不知不扣的卖国贼。
首先，明史是乾隆年间，在张廷玉的主持下完成的，明史的观点自然是出自乾隆的授意。满清旗人是以胜利者的姿态走进北京城的，但他们军事上的胜利却无法掩盖文化上的不足，于是，满清政府希望通过文字狱来实现他们的文化统治。
当年明月在《明朝的那些事儿》中一语道破天机：要诋毁崇祯，无需谩骂，无需污蔑，只需要夸奖一个人——袁崇焕。 虽说痛骂袁崇焕也有相同效果，然而，痛骂袁崇焕至少说明崇祯还是悔悟了的，明朝还是能搞好的;但是捧袁崇焕的意图就不同了。
清朝对历史的隐瞒是前所未有的不遗余力，很多事情至今迷雾重重，故而作者推论袁崇焕案也是被完全地改头换面。袁崇焕在北京被围后下狱受审，但入清朝以后，全部卷宗神秘消失，而同为督师的熊廷弼，其案卷宗却一件不少。这说明袁崇焕案的实情可能完全无法支持“反间计”说，所以乾隆不得不出此下策，毁尸灭迹。
再看当年的历史，袁崇焕被宣告的罪行是“市米资敌”、“潜携喇嘛”、“坚请入城”和“谋款斩帅”，其中“谋款斩帅”一条就是指袁崇焕假传圣旨，杀死毛文龙的事情。
这个毛文龙是什么人?他的官号是左都督平辽总兵官，大概相当于一个军长，而袁崇焕类似于战区总长官，但袁崇焕管不了毛文龙。因为毛文龙自己在后金的后方打下了一块地方叫做东江镇，大概是现在的朝鲜平壤一带，这地方归山东登莱节制。
毛文龙很像李云龙，他是一个颇有匪气的将军，擅长游击战对后金的后方频繁骚扰，立下战功赫赫。
而袁崇焕呢?历史上说袁崇焕好出惊人之语，他曾放出大话，说五年即可平辽，但他的战绩呢?
在毛文龙有生之年，后金一直不敢对明朝大肆出兵，宁远大捷也不过只打了两天而已，两天以后努尔哈赤退兵。直接原因便是毛文龙出兵，直接威胁到后金大本营辽阳。但是在崇祯二年，袁崇焕持尚方宝剑，矫诏斩杀毛文龙，从此以后东江数万兵马无人可以节制，不久零落星散，明朝失去了对后金大后方的军事威胁。在袁崇焕斩杀毛文龙之后五个月，即发生“己巳之变”，后金军取道蒙古绕开山海关，攻破遵化，蓟州，不久即兵临北京城下。
而在这场北京保卫战中，袁崇焕的“关宁军”的作用是什么呢?
当袁崇焕的“关宁铁骑”赶到蓟州时，恰好挡在了后金军的前面占据了蓟门天险，而他也向朝廷信誓旦旦地保证：“必不令越薊西一步”。 那么，事件是怎样发展呢?
事实是，一天之内，后金军轻而易举地越过了袁崇焕的防线。敌军越蓟而西甚至没有多用一天的时间，袁崇焕的揭帖到京师的时候，敌军已经出现在通州，后金军如入无人之境。
袁崇焕为什么要杀毛文龙?天聪元年后金出兵朝鲜，试图拔掉毛文龙的这颗钉子，毛文龙要求袁崇焕趁机攻打后金大本营，但袁崇焕分析当时的形势认为，大明军队没有实力实施反攻，拒绝出兵，并且当时袁崇焕正在和后金考虑议和。
于是，就上演了南宋时“欲和谈先斩岳飞”的一幕。皇太极答应议和，但条件却是杀掉毛文龙。
经过了那么多年，我们早已难辨当年的真相到底是什么样的。不管袁崇焕是因为什么样的原因杀死毛文龙，但不得不承认，正是毛文龙之死，才葬送了明朝。