两个日本朝贡团在宁波的血腥火拼，令明帝国取缔了日本的勘合贸易，为走私打开了广阔的空间
到了1467年，统治日本的足利将军家，发生了内乱，史称“应仁之乱”，自此，日本进入了“战国时代”。
“应仁之乱”中，大内氏迅速崛起，开始争夺原先由细川氏所控制的对华贸易，单独派出使团到中国朝贡，而争夺中国的“勘合”至为重要。大内氏从幕府派往中国的贡使手中，夺得了明朝正德皇帝(1505-1521在位)的“勘合符”，细川氏也不甘后人，从幕府手上拿到了之前弘治皇帝(1488-1505在位)颁发的“勘合符”。显然，细川氏手持的“勘合符”已经过期失效。
更大的流血冲突，便在嘉靖二年(1523)爆发。
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1551年，大内氏的大内义隆因内乱(大宁寺之变)被杀，继位的大内义长于1556-1557年遣使朝贡，但明帝国又将其视为篡位者而拒绝。6年后(1557)，大内义长又被毛利元就所灭，大内氏政权彻底灭亡，日本陷入混乱，“勘合贸易”完全断绝。从建文三年(1401)到嘉靖二十六年(1547)，日本的朝贡使团共计18批(田中健夫《倭寇与勘合贸易》)，至此成为绝响。武装走私成为主旋律，亦商亦匪的“倭寇”则成为主力军。