明孝陵如此恢弘的建筑，对于朱元璋这种将死后看得重如生前的人，地宫一定是非常可观的。但是，限于目前的科技手段和法律，孝陵是不能发掘的，那么孝陵的地宫情况能否知道呢?最近，传来一个令人兴奋的消息——孝陵的地宫状况和结构基本探察清楚了。
江苏省地震工程研究院精密磁测(GPM)研究室主任、物探专家叫张治天，他率领一个工作组，采用精密磁测技术对明孝陵陵区2万平方米的区域进行了大规模的探测，终于揭开了一个隐藏达600余年的谜团—一—明孝陵确系明开国皇帝朱元璋的陵寝，并弄清了地宫的形制、地下埋藏物的基本分布情况等。
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由于该处遗迹是当时发现的靠近神宫的惟一建筑，所以文物工作者猜测该建筑很有可能就是神宫监的所在。然而，到了2000年春，研究人员又在神宫的西南角发现一片建筑遗迹，边宽一米左右的石柱础和少量的绿琉璃构件，这些绿琉璃跟孝陵里发现的一样。距这片遗迹20米左右处，他们也发现了一口明代的水井。都有生活设施水井，而且靠近神宫，两处神宫监，到底谁是谁非?由于没有文献对神宫监的具体方位和数量作过记载，所以只有经过钻探、清理发掘以后才能对此作出正确判断。
皇家陵墓历来是盗墓贼们觊觎的目标，然而令人奇怪的是，明朝灭亡以后，明孝陵地面建筑在历次战火中毁坏殆尽，庞大的孝陵地宫却仍然保存完好，排除了被盗之说。