在关外，八旗亦兵亦农。顺治元年，八旗从龙入关，坐镇北京，为了镇压汉族的反抗，其军事职能越来越突出，八旗子弟渐渐退出生产，以挑甲拿兵饷为生，成为满洲贵族维持异族统治的基石，享有各种特权。综清之世，旗人与民人界限分明，八旗犹如国中之国。当然其内部并非铁板一块，由于族群的差异、归降方式及时间的不同等，内部旗人身份也存在区别。
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满洲八旗、蒙古八旗、汉军八旗之间的差异
满洲八旗与统治者同属一个民族，且满洲各旧部归降较早，在三部之中地位最高。蒙古在清代被满族统治者引为盟友，世代联姻，著名的孝庄太后即是蒙古科尔沁部落之人，蒙古八旗在八旗内部仅次于满洲八旗。而汉军则多来源于投降的明军，归降较晚，且相较于蒙古而言，汉人与满洲的文化差异更大，满洲贵族对于汉人的戒备更重，在八旗内部地位最低，所享有的待遇也相较满洲、蒙古八旗为低。清制，满洲八旗、蒙古八旗2丁一人披甲，而汉军一般为5丁一人披甲。入关时，正当战争频繁之际，满洲贵族仍仅允许汉军4丁一人披甲，后又恢复常制。另一方面，在乾隆时期为了解决八旗核心部分满洲、蒙古的生计问题，还出现逼汉军出旗的现象。
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上三旗与下五旗的区别
在关外时，努尔哈赤创建了极具特色的八旗共政国政制度，八旗的地位是平等的，但其子皇太极坐上汗位后，先后废除诸贝勒按月分值制度、皇上与三大贝勒俱南面坐受制度，取得了独尊的地位，并采取了多种手段，夺取其他旗主之牛录，后独掌三旗。顺治时期，定制两黄旗、正白旗为上三旗，为皇帝直接统辖之民，地位相较下五旗为高，宫廷侍卫也均在上三旗满蒙军中选任。
内务府三旗与八旗的区别
努尔哈赤将旗主、贵族包衣（即家的人）编成单独的牛录，长官称包衣昂邦，入关后，顺治帝将上三旗之包衣划归内务府管理，此即内务府三旗。虽满族之包衣，并非如罗马之奴隶，且多有因皇帝开恩领肥差富贵者，如曹雪芹之祖。但终究有人身依附关系，需为皇室服务，如参加秀女挑选，入宫服侍皇室，相较八旗而言，地位较低。
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内部府三旗内部佐领与管领的区别
入关之初，内务府共有9个满洲佐领，12个旗鼓佐领，其他则多为管领。清代，以兵部尚书身份投降的洪承畴、吴三桂之舅祖大寿、平定台湾的施琅均入内务府八旗，内务府佐领下人对皇帝自称奴才，虽为依附关系，但因为是皇帝家人，常也因此受皇帝照顾，且也有宿卫皇宫之职，并未真正意义上的奴隶。