张居正是为万历朝的首辅，万历初年,因为前朝留下的烂摊子，民间已经不太平，小规模的农民起义此起彼伏。张居正是怎么处理农民起义的？
一个字：杀，两个字：无赦。三个字：杀无赦。
万历元年(公元1573年)，张居正刚上台，就面临一起比较严峻的地方农民起义。
广东东部爆发蓝一清、赖元爵起义。
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广东东部是瑶族和畲族聚居区，民风彪悍，明朝中后期，因为大规模的徭役征发严重，社会矛盾日益加剧，他们就和当地汉族人一起，发动针对政府的农民起义。隆庆年间，蓝一清、赖元爵起义爆发，在惠州、潮州两府山地，据险结寨，地连八百余里，队伍一度发展到数万人。官军竟然一时难以胜之。到了万历元年，愈演愈烈，大有星星之火可以燎原之势。
此时，张居正的改革还没有铺开，但是改革需要一个国内安定大环境。农民起义一旦闹大了，想改也改不了。张居正对此有着清醒的认识。对于农民造反起义，张居正主张露头就打。对此他还有自己的一套理论。历史上著名的“星火燎原”的命题，就是发端于张居正的镇压理论，他说：微火刚起时，一指就能熄灭，及其燎原，“虽江河之水，弗能救矣”。鹏鸟在未起飞的时候，可以俯视，一旦冲上云霄，虽有善射的猎人，也无可奈何。“禁于未发，制于未萌”，才是预防之道。
张居正这篇提出星星之火可以燎原的文章，白纸黑字写在了他的上书中，上书的名字叫《人主保身以保民论》。作为辅政大臣，他明确向君主进言：要保持政权的稳定，就要密切注意刚露头的星火，一举扑灭。
之前，隆庆时期，张居正虽然也是有这番主张，但是毕竟是次辅，话语权有限。这会成为执政者，该实践理论了。
面对潮州起义，张居正果断派冷面杀手殷正茂任两广总督，统帅两广军务，率兵镇压。殷正茂出征前，张居正致信，给出平乱方针：“今当申严将令，调益生兵，大事芟shan除，见贼即杀，勿复问其向背。”
张居正说，南方贼寇犹如野草，铲除又复再生，自古以来南方将领做不到一举荡平。今当申严法令，调动兵力，斩草除根，倘有违反者，一律按军法处置，斩首示众，让怀有异见之人胆战心惊，不敢不听命。要不惜一切代价，确保永世太平。
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“见贼即杀，勿复问其向背”，这是非常残酷的暴力理论，用战争时期形成的孙子兵法来治理和平时期的内政，必然崇奉暴力。综观张居正的内外政策，除了对蒙古俺答实施优抚外，对境内治安，不论是起义还是偷盗，是正义还是非正义，均力行诛杀，从不手软。
得令之后的殷正茂就像领了杀人执照，开始在广东大开杀戒。他以血洗方式，先镇压了三巢、十寨、十三村的起义，再率兵四万进剿蓝一清。历时三个月终将起义彻底破灭。值得一提的，明军镇压起义，俘虏了一万两千多名起义士兵，殷正茂下令，一个不留，与头领蓝一清一同处斩。杀俘，斩草除根。此残酷之举引起朝中争议。但却得到张居正的高度肯定。他得知殷正茂广东的系列战果后，专门写信给他，鼓励地说：“大功克就，岭表辑宁，朝士大夫始服公之雄略，而信仆知人之明。”
这是你建功立业的最好证明，朝中大臣应该对你服气，也应该对我知人善任了。
不久，殷正茂以功累加兵部尚书兼右副都御史。
钢铁般的意志，铁腕般的手段，这是张居正对付安内的策略，也是他的特性。他崇尚军事家孙武用兵法治理国政，推行以暴制暴，以刑止刑，“盗者必获，获而必诛”的主张，给敌对势力以无情的镇压。为了达到这一目的，张居正还以镇压打击动乱的力度考核官员，遇有镇压不得力的，一概严惩不贷。
张居正曾下过这样的指令：“约束不明，申令不熟，是将领之过；约束已明，申令已熟，而士兵不尽力，是士兵之过，杀之无赦。”
说，地方出了乱子，那是官员将官的责任，士兵镇压不出力，是士兵的责任，对待这些不尽责的人，一律杀无赦。
可见，这俨然是一道杀气腾腾的指令，张居正是以立法的形式，驱使官吏肆无忌惮地镇压一切不服从朝廷的造反者。
甚至明知有冤，为了朝廷权威，他也照杀不误。
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万历五年(公元1577年)徽州织丝机工集体抗税，引发骚乱。徽州是个江南名城，位于今天的安徽黄山市境内，能力织造业很发达，但是明朝时给他们叠加的赋税严重，于是就引发纺织工人集体抗税，遭到当地政府残酷打压，抓捕打死不少人。事后，纺织工人持续上访，进京告状。张居正认为：此事虽然由于殷正茂处理欠妥、引起骚乱，但既然圣旨已出，就不准申诉。
他明知这是由官府处理不当而引起的纠纷，本可以协调解决，却坚持不让申诉，只是因为旨令业已颁布，为了不使天下效尤、保住朝廷的脸面，照样施以镇压。闹事的机工因此冤沉海底。
张居正不是不明白事理之人，有的见解也符合民意，例如，他认为地方暴乱之原因，往往是不良官吏惹是生非。但他考察官吏以业绩为准的实质，实际上重视的仍是镇压是否得力，公然鼓励施暴。毫无疑问，有些小股起义乃是弱势群体对压迫的反抗，在他看来，不论起因如何，只要冒犯朝廷，一概杀无赦。以暴力彻底摧毁任何有可能发生的反抗，巩固明王朝的统治才是他最终的目的。