崇祯时运不济，他接手的是一个内外交困的烂摊子，衰亡的征兆在他出生之前早已初见端倪。他力图挽狂澜于既倒，他勤于理政，事必躬亲，常朝不停辍，召对时时举行，十七年来未稍懈怠，然而“所用非人,卒至寇乱,身殉社稷”，崇祯最大的也是致命的缺点就是没有识人的眼光、没有用人的气量，没有纳谏的气度，刚愎自用，自以为是，用人不专，疑神疑鬼，更调频繁，惩处随意，搞得臣下畏首畏尾，离心离德，及至魂归煤山，陪他而去的只有贴身太监一人，愿为他的社稷殉葬的也不过寥寥数人而已。
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十九日凌晨，李自成起义军从彰义门杀入北京城。朱由检咬破手指写了一道给李自成的血书，说自己所以有今天，都是被臣下所误，现在死了也无脸到地下见列祖列宗，只有取下皇冠，披发遮面，任你们分割尸身，只是不要去伤害百姓。他将血书藏入衣襟，登上煤山，自缢于寿皇亭。王承恩也在对面树上吊死殉国。
李自成进城后，将他的尸体抬到东华门，搜出身上的血书，葬在昌平州。当地人民又将他合葬在田贵妃墓中。满清军入关后。将他移葬思陵，谥为怀宗，后改谥庄烈帝。南明政权谥他为思宗烈皇帝，后又改谥为毅宗，史又称崇祯。
崇祯帝卒后，南明弘光年间谥思宗烈皇帝。庙号思宗，后改为毅宗。后金改为庄烈愍皇帝。庙号怀宗。葬北京昌平思陵。