吴起是集兵、法、儒三家思想于一身的战国政治家、思想家、军事家。技多不压身，吴起到底是如何将三者联系起来的，他的军事思想是怎么样的?
由于集中了三种不同的学术体系，吴起的军事思想较为灵活和全面，在《吴子兵法》中，主要描述了吴起的军事思想的细节。吴起在曾申门下学习了儒学，在鲁国季孙氏门下学习兵法，在魏国则学习了李俚的法家思想，他认为政治和军事看似是两个不一样的领域，但是政治和军事息息相关，一样重要。对于一个国家来说，强大的方式最好就是政治和军事一起发展，不可偏向其中的任何一方。国家内部要内修政治文化，国家外部则要做好时刻战斗的准备。这是一个大的范围和方向，在政治和军事并驾齐驱的前提下，吴起认为，一个国家的发展离不开最基础的人民群众的发展，而人民群众的发展又要从多个方面来看待。政治文化、礼义廉耻、法律严明，君主要用道、义、礼、仁治理军队和民众。
另外吴起还提出了自己对战争的分析，他认为军队中的士兵是不一样的，每个人擅长的都不一样，特点也不一样，要学会灵活运用士兵，否则就是靠人数也不能取胜。军队中士兵们分为义兵、强兵、刚兵、暴兵、逆兵等不同性质。战争不是几个人说几句话的事情，是需要血肉拼杀的，所以要决定发起一场战争就要足够的慎重，至少你的心里要有底，知道这次的大概损失和胜负情况，吴起很反对穷兵黩武的做法。
在魏国西河郡担任郡守的那几年，吴起用自己的办法训练士兵，不但改革了魏国的兵制，还创立了武卒制，给魏国的军事方面添加了一道新的兴奋剂。吴起的想法很简单也很大胆，他主张士兵的数量并不是最重要的，士兵在于精而不是多，这是一个最简单不过的道理了。他想要建立的军队，是那种平时严格守纪律，作战时威猛有气势，前进的时候锐不可挡，撤退时脱如狡兔的军队。只是听着形容这支队伍的句子，就仿佛看见了这样一支雄军，若是真的可以建成，那将是多么强悍又灵活的军队啊!
要怎么才能建立这样的军队呢?首先在小小将领的选择上就要择优纳良，将原来军队中的勇士和希望杀敌立功的人挑选出来，给他们丰厚的封赏，给他们的家人加以抚恤，让他们誓死为国家效忠，成为战场上的精魂。在对士兵的选择上也有所不同，要根据每个人的特点和擅长不同，给他们分配不同的工作性质。有的人箭法好，那就安排在弓箭营;有的人埋伏和隐藏功夫好，就派去做侦察兵;有的人剑法好，就做冲锋陷阵的排头兵等等。在编组的时候，熟悉的人要安排在一起，让他们互相进步，同乡同里编组，同什同伍相互联保。在平常的训练上，士兵们必须严格按照学习目标来进行训练，对于任何战场上的阵法都要极为熟悉，特别是要熟悉阵法指挥令，跟着指挥变换阵型。有功者赏，无功者勉，阵逃者罚。恩威并施，刚柔并用，文武兼备。
吴起的军事思想很先进，也很理想主义话，但是他提出来的这些条件，直到现在也是军队中训练士兵们的标准。吴起经历了卫国、鲁国、魏国、楚国四个国家，其中在魏国所立的功劳最大。他的能力有目共睹，实力的确很强，但是他的人格品质方面却遭受了质疑。相传吴起为了能够当上将领，杀掉了自己的妻子。杀人后将老母亲留在卫国，老母亲死了也不回国奔丧。不孝不义之徒，很多人都是这样评价吴起的。但是，要说吴起有什么大的过错的话，那却是找不出来的。