顺治在位期间发生最重大的一件事情莫过于顺治帝废后了，当时的朝野震惊，百姓诧异。不过顺治帝废后和他的婚姻、亲政之路密不可分，顺治帝的皇后是博尔济吉特氏，也就是大名鼎鼎的孝庄文皇后的亲侄女，顺治帝的表妹，对于顺治帝来说这亲上加亲的婚事非常不满，究其原因这位皇后有太多不让顺治顺眼的地方。
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顺治帝在提出废后以后，孔子的后裔孔允樾表示，皇后无能是最好的，这样就不用担心她会像武则天和吕后那样来威胁皇位、秽乱朝政。当时的礼部尚书胡世安也提出了皇后之位及其重要，不要擅自废掉，会遭受非议的。郑亲王联合百官上书，范围废除。在压力如此大的情况下，顺治帝眼看这样的情势，并没有被吓到，反倒是列举了他和皇后婚姻生活的两年中，本就没有了夫妻情感，名存实亡的婚姻不要也罢。面对顺治帝的坚决态度，郑亲王倒戈相向，态度来了180度的转变，首先站出来支持顺治帝废后，这样一来带动了朝中的百官，于是顺治废后成了定局。
顺治帝在达到了目标以后，下旨废除皇后，降为静妃，静妃被发配到了蒙古草原上，穷其一生，再也没有回到皇宫。