当顺治皇帝染病的消息传出宫后，汤若望非常揪心，立刻进宫，要求觐见陛下。顺治帝听闻后非常感动，他下谕旨告诉汤若望，他的身体实在不允许他有任何走动，但汤的忠顺令他感动，他视汤为玛法(译者注：满语中玛法的意思是爷爷)，所以有机会一定召他觐见。汤请内臣向皇上转奏，神爱世人，圣上的病已经十分危急了，他恳请皇帝可以认真读一遍他送去的《福音书》，书上记载着天国与人释罪后可得永生。顺治帝听从了汤的建议，亲自阅读了《福音书》，之后他发出感慨：汤是真正忠于他、关怀他的人啊!但是他罪重错繁，这样的人是没有颜面前去天国的。如果他这次可以痊愈，一定会接受洗礼信奉汤所信奉的宗教，但是现在身患重病，是没有办法做这件事的。
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在四个月后，发生了一起事故，钟楼失火了，大钟也同时受损。但过了两年后，汤又用他的机器将另一口钟吊到修复的楼上。据传教士南怀仁说，这些钟起码有两万五千多德国磅，比欧洲人公认的德国艾府城巨钟还要大得多。
太皇太后此时是清朝的实际掌控者，她称汤为“义父”，对汤抱有善意的好感，经常赏赐给他礼物，而在御宴时，太皇太后也时常将自己的食物分于汤，以示特别的恩惠。直到1664年，汤的地位一直不曾变动。