公元1566年，即嘉靖四十五年，时为户部云南司主事的海瑞看不惯明世宗荒废朝政，但问鬼神不问苍生，各地官吏也投其所好，经常进奉一些所谓的祥瑞之类的东西，朝中也无人敢直言相劝阻，于是海瑞自备好了棺材，上书明世宗，其书名为《治安疏》，奏章写的十分直接，口气也十分严厉，不给皇帝留面子，指出了当时朝政的许多缺陷，明世宗勃然大怒，将海瑞打进锦衣卫大牢，“已下锦衣拷问”，估计海瑞吃了不少苦头。刑部裁定应该判海瑞绞刑，“刑部拟绞”，但是明世宗似乎没有下定决心，或许是嘉靖帝病了，同时主要是徐阶压住，刑部的文件一直没有批下来。
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不管怎么样，何以尚毕竟上书救过海瑞，海瑞多少得有点感恩之情吧。可是，何以尚后来降职南户部郎，海瑞官居南少宰，二人见面时，何以尚要求与海瑞享受同等礼节，海瑞居然没有答应，何以尚极其受伤，拂袖而出，海瑞也并不觉得内疚，从无半点歉疚的表示。二人都是硬脾气，故而不能相容，“盖二人俱负气士也。”