科举考试是封建统治者揽延人才、收买人心的一种手段，在封建社会的几千年历史中对维护社会稳定发挥着重要的作用，“野无遗贤”常常被统治者当作政治清明来炫耀，唐太宗李世民就曾经很得意的看着鱼贯而入的社会俊彦说：“天下英雄尽入吾觳。”总体来看，科举考试还算比较公平，改变了魏晋以来“上品无寒门，下品无士族”的用人体制，让更多的社会底层才俊参与到政治活动中来。当然，历史上也有几次科举考试十分荒唐，我们姑且称为零纪录的考试，至今仍然成为人们茶余饭后的谈资。
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经过查实，本次考试并没有作弊，南方举子的考试成绩确实都比北方举子的成绩好，举子们的考试成绩都是属实的。朱元璋也知道刘三吾是一位刚正，不会因私枉法的人。他相信刘三吾对考生成绩的判断，但是为了平息北方士子的愤怒情绪，朱元璋要求刘三吾从北方的举子中挑选几个来一并上榜。没想到刘三吾这次真是倔过了头，他拒绝更改考试成绩。朱元璋听了大发雷霆，气得将刘三吾赶出京城，还把其他几位考官都撤了职，重新组织考试。北方举子听到这个消息后，都大声欢呼，得寸进尺，要求皇帝为他们主持公道。这次由朱元璋亲自督考，主持复试的翰林院侍讲张信很不知趣当众评点几位北方举子的试卷，说北方试卷确实不如南方卷，原来考官绝无偏袒之事……朱元璋闻言顿时勃然大怒，他指责官员们互相包庇，是有意将水平不高的卷子送交皇帝审阅以蒙蔽皇帝。他宣布，以前的结果一概无效，由自己亲自裁定。一个月后，复审结果宣布，这次朱元璋又走了极端，新入选的61名举子全部是北方人，一个南方的举子都没有。更可悲的是，参与这次的主考官和一些考生被指称与十几年前的胡惟庸案、蓝玉案有牵连，全部被处死。朱元璋不以成绩取士，并不是简单的科举制度问题，而是血淋淋的政治斗争的需要。可怜一批正直不知变通的大臣成了专制体制下的牺牲品。