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考古工作者在陵园区域探测到水银浓度比周围地区异常偏高，经探测发现这些水银来自秦始皇陵的封土之下。同时，也发现秦始皇采用了先进的排水系统阻止地下水进入地宫中，这种排水方式至今仍在一些现代建筑的地基建设中被采用，如中国正在建设的中国大剧院。
秦始皇陵考古工作队从1998年到2003年对秦始皇陵进行研究，同时也发掘了部分陪葬墓，这项工作因为缺乏资金而中断。
秦始皇陵内城面积约为2.13平方公里，若加上已发现各种陪葬坑的范围，面积将达60平方公里。结束了15年的统治，秦始皇在49岁住进了他花费了约38年修筑的地宫内。
秦始皇陵两千年来的保存完好，然而以现在的技术，尚不能够完好的把文物挖掘出来，为了对历史负责，对文化遗产的负责，在条件不成熟的时候，不挖掘保持它的神秘性才更有价值和魅力。米切尔·佩塞特说：“让秦始皇和他的地下宫殿继续沉睡地下，既是对逝者的尊重，也是最安全的保护文物方式。”