吴三桂杀害永历帝后，清顺治帝给他很重的奖赏，封他做平西王，让他镇守云南、贵州，给他许多特权，管辖两省的文武官员，可以随意任免官员;处理军民一切事务，还可以开矿山，煮井盐，铸造钱币，清廷每年还要拨给他饷银九百多万两，占了国库的很大一部分。吴三桂自恃功高，在云南称王称霸。
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康熙帝临危不惧，停止执行耿精忠、尚可喜两藩的撤藩命令，将他们从造反行列中暂时分化出来，孤立吴三桂;同时迅速调兵遣将，阻挡吴三桂的进攻。由于吴三桂在军事上犯了错误，他的军事攻势持续了几年就停止了。双方在西北、西南、中南、华南相持了八年。公元1678年，吴三桂七十八岁，等不及了，在湖南衡阳匆匆忙忙地登上皇帝宝座，国号大周。可是到这年秋天，他就病死了。
此后，形势大变，清军的进攻越来越猛烈。到公元1681年，清军攻下昆明，吴三桂的孙子吴世自杀，“三藩”的叛乱终于彻底平定。