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不只是“壬寅宫变”。，嘉靖帝在位期间还发生了另一个事件，那就是“大议礼之争”。嘉靖帝当上皇帝后，不顾朝臣的反对，把自己的父亲追尊生父为兴献帝后又加封为献皇帝。生母为兴国皇太后，改称孝宗敬皇帝曰“皇伯考”。嘉靖十七年兴献帝被追尊为“睿宗知天守道洪德渊仁宽穆纯圣恭简敬文献皇帝”，并将兴献帝的牌位升袝太庙，排序在明武宗之上，改兴献王墓为显陵，大礼议事件至此最终结束。嘉靖帝这些行为，完全不符合礼制。他为了让自己的父亲的牌位位居太庙，不仅手段铁血的斩杀了一干反对的大臣，还将明太宗朱棣的庙号改为世祖，使得明王朝成为唯一一个一国两祖的皇朝。
正是因为有了以上两点污点，嘉靖帝才被有些人评价为昏庸无道，给自己的政治生涯，留下了不好的收场。