康熙早年英明神武，但是晚年却有些保守宽怂。康熙中叶以来，土地兼并严重，贪官横行。
一个漕运坐粮厅的下级官员勒索运丁，十年就得到四十万两银子。户部堂司官百余人，受买办草、豆商人的“馈送”，十年来也能得脏银七十多万两。
这种情况，在“天高皇帝远”的台湾府显得更加严重。一甲土地征谷八石八斗，折现银二两六钱四分多，比内地高出一倍以上。人民交了沉重的赋税，还要遭到另加“火耗”、“贴水”以及兑换纹银方面的额外盘剥。
此外，驻守台湾的不法官员，除敲诈勒索之外，又禁止人民输入铁器、禁止人民采伐树木、禁止结社并残酷逮捕和屠杀。
官逼民反，从古自今都是这个理。所以在康熙六十年，台湾人民在起义军领袖朱一贵领导下，揭竿而起了。
朱一贵原本是福建漳州人，迫于讨生活压力，才和父亲一起漂流到台湾。到台湾后，朱一贵充当台厦道的辕役，不久被当局解雇，后来靠养鸭度日。朱一贵训鸭有方，早晚鸭群编队出入，当地人很是佩服。
他又非常乐善好施，对于穷困路人、草泽莽夫，也都宰鸭煮酒、款待和留宿。因此人们称他为“小孟尝”，对他十分爱戴。
和朱一贵相反，台湾当地官吏却异常苛暴。比如台湾知府王珍，整天不理政事，政事都交给自己的二个儿子操办。康熙六十年，王珍父子大打出手，搜捕了几十个秘密结社的人，还杀死了几百名违禁砍伐竹、木的群众，一时激起了民愤。
四月，庄民黄殿等来到朱一贵家中，说：“如今当官的只知道吃喝玩乐，政乱刑重，正是该举事的时候了。”因为一贵姓朱，大家便让他假冒明朝后裔来号召群众。
于是李勇等五十二位首领，拥了一贵，来到黄殿的庄中，竖起红旗，旗上写着“大元帅朱”的字样，宣布起义，一时闻风赶来的，有数百人。当夜就攻下岗山汎。
台湾总兵欧阳凯，派右营把守周应龙领兵镇压。周应龙战战兢兢，两天才走二十里，在槟榔林被起义军击败。起义军败了官军，声势大振，台南人民也在杜君英率领下举行了起义。
躲在二滥的周应龙慌了手脚，下令全体官兵，杀一义兵，赏银三两;杀一义军首领，赏银五两。官兵为了图财，纷纷滥杀老百姓充数，这更激起了广大人民的反抗。
五月二十六日，朱、杜合兵数万后，猛冲春牛浦，杀得清军落花流水。清军守备、千总、把总死了大半，不少还被活捉。副将许云被击得遍体鳞伤，左手也被砍断。总兵欧阳凯也被归顺起义军的白总杨泰刺死。从黎明到中午的战斗，起义军尽歼清军，并占领台湾府。
五月二十八日，起义军将领拥立朱一贵为中兴王，建号“永和”。朱一贵头戴通天冠，身着黄袍玉带，在钟声中登高台受贺，并大封群臣(国师、太师、国公、将军、侯、都督、尚书等)，一仿明朝政体，堪称国中之国，与大陆大清朝分庭抗礼。
朱一贵起义，传到了大陆，大清朝廷闻讯大惊。闽浙总督满保，立刻派福建水师施世骠、南澳总兵蓝廷珍率兵一万二千、大小船舰六百只前去镇压，战斗异常惨烈。战斗一直持续到七月三十日，朱一贵及其手下猛将翁飞虎被土豪杨雄、杨旭擒拿住送往蓝廷珍大帐。
见到蓝廷珍，一贵昂首挺胸，不肯下跪，当众就被打折了腿。一贵还是不屈服，且对飞虎说：“大丈夫死忠义耳!”飞虎答道：“敢不免从!”
两人后被押送到北京斩首。朱一贵牺牲后，小股义军仍坚持斗争，战事一直持续到雍正四年结束。