三大自然灾难之谜是指发生在中国明朝的王恭厂大爆炸(天启大爆炸)、印度的死丘事件和俄罗斯的1908通古斯大爆炸。对于三个自然灾难人们提出了各种猜想，始终没有一个定论。
一、天启大爆炸，也称王恭厂大爆炸或“王恭厂灾”，发生于1626年5月30日(明朝天启六年五月初六)、端午节次日巳时(上午9时)，地点为明朝北京西南隅的王恭厂火药库附近区域，造成半径达750公尺、面积达2。25平方公里的爆炸范围及2万余人的巨大死伤。后人估算，此次威力约为1至2万吨当量的TNT，相当于广岛原爆。“须臾，大震一声，天崩地塌，昏暗如夜，万室平沉。东自顺城门大街，北至刑部街，长三、四里，周围十二里，尽为赍粉。屋数万间，人二万余，王恭厂一带糜烂尤甚。僵尸重迭，秽气熏天;瓦砾盈空而下，无从辨别街道门户。伤心惨目，笔所难述。震声南自河西务，东自通州，北自密云、昌平，告变相同。京城中即不被害者，屋宇无不震裂，狂奔肆行之状，举国如狂，象房倾圯，象俱逸出。遥室云气，有如乱丝者，有五色者，有如灵芝黑色者，冲天而起，经时方散”。“自西安门一带皆飞落铁渣，如麸如米者，移时方止。自宜武门迤西，刑部街迤南，将近厂房屋，碎然倾倒，土木在上，而瓦在下。杀死有姓名者几千人，而阖户死及不知姓名者，又不知几千人也。凡坍平房屋，炉中之火皆灭。唯卖酒张四家两三间之木箔焚燃，其余则无焚毁，凡死者肢体多不全，不论男女，尽皆裸体，末死者亦皆震褫其衣帽焉。”关于这次神秘事件，有人说是因为火药厂爆炸，有人说是因为龙卷风还有人认为是地震。
二、通古斯大爆炸，是指1908年6月30日上午7时17分发生在现今俄罗斯西伯利亚埃文基自治区上空的爆炸事件。爆炸发生于通古斯河附近、贝加尔湖西北方800公里处，北纬60.55度，东经101.57度，当时估计爆炸威力相当于20百万吨TNT炸药，超过2,150平方公里内的8千万棵树焚毁倒下。
据报道，当天早上在贝加尔湖西北方的当地人观察到通古斯大爆炸一个巨大的火球划过天空，其亮度和太阳相当，几分钟后，一道强光照亮了整个天空，稍后爆炸产生的冲击波将附近650公里内的窗户玻璃震碎，并且观察到了蘑菇云的现象，这个爆炸被横跨欧亚大陆的地震监测点所记录，其所造成的气压不稳定甚至由在当时英国刚被发明的气压自动记录仪所侦测。这个事件也有众多猜想，包括陨石撞击说，核爆说及外星飞船说。
三、印度死丘之谜，“死丘”，即印度历史上的“摩亨佐达罗”遗址。在印度语中即是“死亡谷地”的意思。1922年，印度考古学家巴那耳季，在印度河的一个小岛屿上发现了一片古代废墟。从遗迹上看，这里原来是座城市，好像在3500年前的某一天突然毁灭了。在后期的研究中，考察人员找到了此地发生过多次猛烈爆炸的证据。爆炸中心1 平方千米半径内所有的建筑物都成了粉末。距中心较远处，发现了许多人骨架。从骨架摆放的姿势可以看出，死亡的灾难是突然降临的，人们对此毫无察觉。这些骨骼中都奇怪地含有足以与广岛、长崎核袭击死难者相当的辐射线含量。不仅如此，研究者们还惊奇地发现：这座古城焚烧后的瓦砾场，看上去极像原子弹爆炸后的广岛和长崎，地面上还残留着遭受冲击波和核辐射的痕迹。其中原因，至今争论不休，主要是核爆和黑闪电这两种说法。
细观这三件事的描述及考察资料，会发现这三件事都有一个相似的情景：就是都发生了剧烈的爆炸，破坏力极大，波及范围很广，其中天启爆炸和通古斯爆炸都记载了有巨大的蘑菇云，而死丘发现的瓦砾极像核爆过后的琉璃状物体，这不禁让人想起了日本广岛、长崎核爆过后的场景。会不会这三起事件都是由于某种原因出现了核爆呢?是不是在未来的某次核爆无意间穿越了虫洞来到了古代呢?这时可能有人会说，天启大爆炸虽然威力很大，但是没有核爆的那种焚烧的记载啊，这里小编只能猜想可能这次的核爆不同于普通的原子弹而是类似于中子弹，污染很小但是冲击波很大而造成了如此巨大的破坏。以上只是小编根据资料自己猜想的，这些神秘事件真正的原因还是要留给各位科学家去研究了。