首先是因为高宗无后，这是大前提。如果高宗有后，他怎么会把皇位让出去呢?别说让给太祖一脉，就是让给他亲侄儿，也是不太可能的。
高宗为什么无后?因为他唯一的儿子赵旉，在颠沛流离的生活中，惊吓过度去世了。赵旉夭折后，高宗就再也不生育了。
(影视中的宋高宗)
高宗为什么不生育?原因很多，一是整个赵皇室生育能力都差，这可能是家族在生育上的一些特征。统计一下，宋朝因没有儿子，皇位旁落的，除了高宗外，还有仁宗、哲宗、宁宗三位皇帝。二是高宗曾多次用壮阳药。很可能是这些壮阳药伤了高宗的身体，让他丧失了生育能力。三是史料记载，有一次高宗正在临幸妃子时，金兵突然杀到，高宗惊吓过度，从此就没了生育能力。
不管是什么原因，总之高宗没有儿子。没有儿子，就必须要找个儿子来作为将来的皇位继承人。
找谁呢?其实高宗一开始并没有到太祖一脉去寻找，而是找太宗一脉的人。因为太宗一脉的，大都是富贵人家出生，从小受到了良好的教育。而太祖一脉，因为经过了一个半世纪，绝大多数已经沦为平民，所受教育严重不足。
但问题是，经过靖康之难后，出生在富贵人家的太宗一脉的皇室成员，基本上都被金国俘虏去了。因为当时金国攻陷开封以后，大肆搜索赵皇室成员，目的是全抓到送到金国去。反而是那些已经沦落为平民的太祖一脉的后人，没人注意，才被保留了下来。
(金国北伐)
所以，从这个角度来说，高宗选择太祖一脉的人，不是他自己标榜的：“大宋江山本为太祖创立，太祖铁面无私，有子却将皇位传给弟弟。如今太祖后人却混迹民间，朕预备还位于太祖后代。”
这是原因之一。第二个原因，他之所以把皇位传给太祖一脉的后人赵昚，是因为赵昚对他，比他亲儿子(如果他有亲儿子的话)对他还好。历史上被称为“孝宗”的皇帝，除了明孝宗朱佑樘，就只有宋孝宗赵昚。而且赵昚还是历史上的第一个孝宗。宋孝宗赵昚对宋高宗有多好?
一是当宋高宗把皇位“禅让”给宋孝宗后，宋孝宗给他的待遇非常优厚。每月零花钱就达到四万贯，是当时一品大臣最高月俸的一百倍。要知道这只是零花钱，还不包括宋高宗所住的德寿宫的日常开销和运行。逢年过节，高宗生日，孝宗还不断孝敬寿礼，银五万两、钱五万贯是最常规的进献。
(宋孝宗像
二是宋孝宗凡事都会前往请示宋高宗。重大的人事任命，都要听高宗的意见。宰相上任，第一件事就是去感谢高宗，听他的“圣训”。
三是高宗去世以后，宋孝宗一反古代君主守孝，以日代月的旧规，坚持要守孝三年。并因此在两年后，孝宗就把皇位让给自己儿子，说是想一心一意守孝。
如果说赵昚在高宗对他的考察期间表现得很孝道不足为据的话，在他当了皇帝，依然对高宗如此孝道，就可以看出，赵昚这个太祖一脉的后人，实在是高宗最恰当的继承入选。
从以上两点可以看出，高宗把皇位传给太祖一脉，并非高宗的主观选择。