清朝的六部指的仍然是吏、户、礼、兵、刑、工六个部。六部在上层结构中人员配置基本相同，各部均设置尚书满、汉各一员，最初满尚书为一品，汉尚书二品，至顺治十六年将满尚书降为二品，康熙六年又升回一品，九年又降回二品，雍正八年更定满汉尚书均为从一品，自此为定制。尚书下面有左右侍郎，亦满汉各一员，雍正八年定为从二品(官品比尚书低一品两级，变化与尚书同)。六部属官有堂主事分管清档房的满人二员，分管汉本房的满人二员，汉军旗一员。此外还有司务厅司务，满汉各一人，及善本笔帖式若干。
六部除了这些属官外，还划分有若干清吏司，分别对各部的不同事务。我接下来分部一一介绍，由此诸位可简单了解清代各部只能之大要。
吏部分为文选、考功、验封、稽勋四个司，共设郎中满人九员，汉人五员，蒙人一员，其中文选司设官最多，机构最为庞大，考功司次之。其下有员外郎、主事、笔帖式;另有“学习行走者”，额外司员，七品小京官(另五部因其不同职司，亦有其他属员，为免文繁，不一一介绍了)。其中文选司最为重要，掌官员铨选、班秩迁除。自九品十八级以至未入流小吏的迁谪用黜皆属文选司职能。考功司负责官员考课，包括三年一次的考绩和其他的官员考核，考核结果立册记录，作为官员的升迁劾免，议罪论功等的依据。稽勋司掌管勋级、名籍、丧养，包括汉官和八旗贵族，掌握了官僚及贵族的福利待遇。验封司则掌管贵族、土官的封、荫等事务。六部以吏部为首，因为吏部管理帝国的人事工作，权力最大。
户部有十四个清吏司，按省设置(清初十五省，湖广省辖今两湖，江南省辖今江苏、安徽，陕西省辖今陕、甘。直隶不设清吏司。)，分省掌民赋及其他赋税(盐课、钞关等)，同时掌管八旗廪禄，军士粮饷。户部也很重要，掌握财权。
礼部有典制、祠祭、主客、精膳四个清吏司，分别掌管科举，国家祭祀，与外国的封贡和交聘，以及宴飨，和官员的赐食。
兵部有武选、车驾、职方、武库四司，分掌武官选授，舆图管理、关禁、海禁，马政、驿传，武器、兵籍以及乡、会两级武举。
刑部分省设十七个司(十八省中，两湖设一个，陕甘设一个，另多设奉天)，分掌各省刑名。此外，又设督捕清吏司。
曾任吏部尚书的索额图
工部分营缮、虞衡、都水、屯田四个司，掌握工籍，及各项营造工程，官用器物，河渠水利。值得一提的是屯田指的是修帝王陵寝和王、公、百官坟茔，容易引起误解，特此说明。
除此之外，清代还有个乐部，为典乐大臣，没有人员限制。另外，六部情况十分复杂，我这里只是简单介绍，为避免繁琐，有些地方失于疏漏，有些仅是典则而与实际情形可能有所出入。