吴大澂精于鉴别和古文字考释，亦工篆刻和书画。吴大澂书法以篆书最为著名。他的篆书很有特色，将小篆古籀文结合，功力甚深，即平时书翰也常用工整精绝的篆字为之，规矩整齐，别有情致。早年从陈硕父学篆书，中年以后又参以古籀文，书法益进。他开始学秦代小篆刻石，书法酷似李阳冰。后受杨沂孙的启示，将小篆与金文相结合，并用这种方法书写《论语》、《孝经》以及信札。他的篆书大小参差、渊雅朴茂，在当时是一种创造。他对金石文字有精深的研究，开拓了对先秦文字的广阔的视野，使他的篆书从中汲取了不少的营养。吴大澂写篆书，喜用隶书书款。他的隶书横平竖直，亦取法汉碑。行书学曾国藩，又颇有黄庭坚的趣味。吴大澂又以诗词及散文著称。著有《愙斋诗文集》、《说文古籀补》、《字说》、《愙斋集古录》、《古玉图考》、《权衡度量试验考》、《恒轩所见所藏吉金录》、《吉林勘界记》、《十六金符斋印存》等十余种。
吴大澂，做《古玉图考》，对古玉的颇为有识。也喜欢紫砂壶，曾请过当时的制壶名家黄玉麟来自己家里造壶，其壶底有阳文的“愙斋”款，壶形古朴，善画山水、花卉，书法精于篆书。