1910年2月12日，入藏川军进驻拉萨，十三世达赖喇嘛在英印当局鼓动下逃往印度。清政府为了加固边陲，派遣川军进驻西藏。1909年6月，川军入藏，达赖密令藏军沿途抗阻。6月25日，清政府宣布达赖罪状，革去其“阿旺罗布藏吐布丹甲错济寨汪曲欲勒朗结达赖喇嘛”的名号，同时令驻藏大臣联豫依例寻访灵童，另立新达赖。
十三世达赖喇嘛，即阿旺罗桑土登嘉措鸠差旺觉却勒南巴甲哇巴桑布，简称土登嘉措，1876年5月5日生生于西藏拉萨东南部的达布地区，1879年5月13日坐床。
十三世达赖喇嘛转世灵童拉木登珠
1903年(清光绪二十九年)，英国军队第二次入侵西藏，次年攻占春丕、帕里，直逼江孜，受到藏军有力的阻击，这就是西藏历史上的江孜保卫战。之后，8月3日英军占领拉萨。
十三世达赖喇嘛
十三世达赖在英军抵达拉萨的前夕，从布达拉宫出走，经黑河，越过唐古拉山，而进入青海，前往外蒙古，意图经库伦逃往俄国，被清朝驻外蒙古大臣和从北京钦差大臣劝下。而驻藏大臣有泰借机向清朝政府“弹劾”十三世达赖“平日跋扈妄为，临事潜逃无踪，请褫革达赖喇嘛的名号。”清朝政府回电：“著即将达赖喇嘛名号暂行革去，并着班禅额尔德尼暂摄。”
后人认为，十三世达赖是在英军占领拉萨时被迫出走，是为了避免被英军俘获。
十三世达赖到达外蒙古以后，即通过清政府库伦办事大臣德麟向清政府代表请求援助抗英。清政府“革除”达赖名号引发西藏僧俗的不满，驻藏大臣有泰也感到不妥，于是向清政府请求“开复达赖名号，以顺番情”。
十三世达赖
这时，辛亥革命成功，清帝退位，民国成立。1912年藏历5月5日，十三世达赖从大吉岭启程回藏，曾与九世班禅会晤于热隆寺，旋又转到桑顶寺，此时拉萨战事尚未结束，他在桑顶寺住了两个月，8月29日离开桑顶寺，12月16日到拉萨。当时，国内政局已发生新的变化，孙中山先生辞去大总统，袁世凯继之。1912年(民国元年)7月19日，北洋政府设立蒙藏事务局，任命蒙古喀喇沁王爷贡桑诺布为总裁。十三世达赖主动给贡桑诺布写信，派蒙古族喇嘛罗布桑东珠尔为代表，前往北京。
收到十三世达赖来信，袁世凯于民国元年10月28日发出恢复十三世达赖名号的命令：“……现在共和成立，五族一家，前达赖喇嘛诚心内向，从前误解自应捐释，应即复封为诚顺赞化西天大善自在佛，以期维持黄教，赞翊民国，同我太平。此令。”