百慕大三角位于大西洋西侧百慕大群岛、佛罗里达海峡和大安的列斯群岛东端的波多黎各岛之间。大部分位于北纬20°～30°之间，属于北热带。这里全年主要受热带气团控制，盛行东北信风。夏秋多热带飓风，狂风怒吼，常形成10多米高的水墙，还经常可以遇到海龙卷，它能把海水吸到几千米的高空，给航行罩上了可怕的阴影。
而且，百慕大三角正处在南、北美之间地壳断裂带的北缘，火山和地震活动非常强烈，海底地形十分复杂。百慕大三角的下面，大部分是深达6000米以下的北亚美利加海盆;北部是突起于四周深海盆的百慕大海台，西和西南侧是靠近大陆和群岛的广阔的大陆架，南端是深达9215米的波多黎各海沟。
此外，百慕大三角附近既有明显突出的半岛如佛罗里达半岛、尤卡坦半岛，又有被半岛围起来的较封闭的海湾墨西哥湾，还有众多的岛屿和海峡：巴哈马群岛、大安的列斯群岛和小安的列斯群岛等1200多个岛屿。这些岛屿面向浩瀚的大西洋，屏障着加勒比海，大大增加了洋流的复杂性。大西洋北赤道暖流在安的列斯群岛附近大部转向西北，从百慕大三角海区穿过。另外，从墨西哥湾经佛罗里达海峡流出的佛罗里达洋流，非常强大，宽度扩及整个海峡，达150公里，洋流深800米，每昼夜流速为130～150公里。如此“浩浩荡荡的大军”也从百慕大三角海区通过。百慕大三角海区洋流复杂，势强流急，遇难的飞机、船只即使不沉入洋底，也会被强大的洋流冲得无影无踪。百慕大三角海域又是马尾藻海的一部分，海面布满了以马尾藻为主的褐色藻类，不利航行。
关于百慕大三角的具体位置，不同作家有不同说法，且百慕大三角的面积也随不同的作品而变化。
研究探索
物种考察
据英国《每日电讯报》报道，来自14个国家的28位海洋学专家于2006年4月份在百慕大三角海域进行了为期20天的考察，将生活在海面到海底4.8公里深处的浮游生物“一网打尽”。在捕获的数千种生物中，科学家已经对500种进行了分门别类，并对其中220多种的基因序列进行了分析。结果显示，至少有20种浮游生物是第一次发现。此外，科学家还发现了120余种鱼类，其中有几种也是百慕大的“特产”。
这次考察是全球性的“海洋生命大普查”项目的一部分。负责考察的美国伍兹-霍尔海洋地理研究所的彼得·维贝博士表示：“我们正在绘制海洋浮游生物的分布图，就像天文学家绘制太空星图一样。”世界目前有7000种已知的浮游生物，到2010年数目可能翻番。科学家希望能将所有的浮游生物登记在册，揭示它们在地球气候和海洋食物链中扮演的角色。
根据粗略估计，每1万磅浮游植物能养活1000磅小浮游动物，后者又能为100磅大浮游动物提供食物，而它们又能喂饱10磅小鱼。最后这10磅小鱼将成为1磅大鱼的盘中餐。浮游生物不仅是海洋鱼类最根本的食物来源，而且对净化大气功不可没。海洋能吸收空气中的碳元素，这在很大程度上要得益于浮游生物的活动。
异常地磁带
百慕大三角的奇怪之处，在于海洋和大气层。此处的海洋和大气层发出的波段与其他海洋区域不同。因此，很多船只和飞机在此消失。卫星记录的数据显示，在南大西洋存在地磁异常带，这里只存在地球内部辐射。这条辐射带被命名为范艾伦带。
地球辐射带有两个外部辐射和内部辐射。他们到达地磁层积累高能粒子，从而防止他们侵入地球，内层带主要有质子组成，而外层带充满了电子。内外层带的形状都像甜甜圈。美国科学家詹姆斯 范在分析来自卫星“探险者一号”的数据后发现了内层带。因此百慕大三角辐射带被命名为范艾伦带。
这也证明了前苏联物理学家谢尔盖 维拉诺夫和亚历山大的研究。科学家表示，正是因为百慕大三角存在一条地磁带才产生了这种罕见的地理情况，他们是通过俄罗斯的三号飞船进行数据采集的。数据显示，当出现长时间的太阳活动时，例如耀斑、太阳黑子，地球有时候会发生变化出现第三个波带。太阳状态稳定的时候，这层波带会自然消失。2012年，美国航天局发射两颗测量卫星。通过他们的测量，得到的数据显示，该地区的粒子可以瞬间从0加速到接近光速，除此之外还发出超低速电磁波。
意大利人用一些无人认领的人造卫星来采集数据，他们发射了名叫BeppoSAX的卫星。该卫星自1996年到2003年工作。当卫星通过百慕大三角上方时，明显感受到辐射增强，飞离百慕大时辐射逐渐消失。
海底金字塔
1967年，一位美国飞行员罗伯尔·布卢斯和助手迪米特来·勒皮科夫驾机在百慕大海区的巴哈巴群岛一带低空飞行。突然他们发现比米尼岛水面下有一个巨大的长方形物体。第二年8月，考察组来到比米尼岛水域展开水下考古工作，发现，在比米尼岛水下，巨大的石头建筑群静卧洋底，它们结构严密，规模宏大，形状变化多端。长达1600米的大石墙，由长4.5米，宽6米，高3米的大石块砌底，每块大石至少重25吨。石砌的街道，还用长方形或多边形的石头排列出各种图案花样。一座高42米，每边长54米的平顶金字塔，沉睡在距海面近400米的水下，另外还发现有码头、港口设备遗迹和大理石的雕像。
1978年，国际潜水中心主任罗歇韦率领一部分队员来到百慕大“魔三角”附近考察，突然大晴天起了风暴，海面瞬时间迷雾茫茫，白光直射天空，小船已无法控制，他们只好舍身潜入海里。当潜入100米深处时，他们看到了一个巨大的金字塔，它有两个大洞，海水以极快的速度从洞中穿过，激起海面怒涛狂卷，水雾飞腾，工夫不大，当这一现象消失，海面又恢复了平静。经细心测定，他们发现，坐落在洋底的金字塔高200米，塔尖距海面100米，塔的每边长300米，建筑年代约比埃及金塔早7000年。由于海水太深，环境复杂，水下勘察的科学家无法断定，该金字塔与大西洋底的其他古建筑群是否系同时代的产物。
在发现这座巨型水下金字塔的前两年，科学家们就在其东面发现有一座金字塔深藏在百慕大海区的底部，它的塔顶离水面达700米。对大西洋中百慕大海底文明遗址的最新发现是在1989年，两名挪威潜水员在“魔三角”的一个水底平原上见到一座古城。他们二人用水底摄影机拍下了有关镜头，从中可以看到许多纵横交错的道路，一座座圆房顶的建筑物排列道路两旁，此外还有竞技场及长方形的建筑物。它们都保存完好。这两位挪威人自信发现了柏拉图所提到的“亚特兰蒂斯古陆”。
2012年，美、法两国的科学家联合其他国家正在对百慕大三角区的海床进行调查，声明发现了一个人类从未发现的金字塔。金字塔周围长300米，高200米，海床上露出的部分，从底部到顶尖的高度是100米。初步推断这个结构是由玻璃或者类似玻璃的材质组成，因为它全部都是光滑，部分属于半透明的形态。