在人类战争史上，细菌武器的使用由来已久。最早使用细菌武器的实例，可追溯到1349年。鞑靼人围攻克里米亚半岛上的卡法城时，由于城坚难摧，攻城部队又受到由中国向西蔓延的鼠疫大流行的袭击，他们便把鼠疫死者的尸体从城外抛到城内，结果使保卫卡法城的许多士兵和居民染上鼠疫，不得不弃城西逃。
1763年，英国殖民主义者企图侵占加拿大，但遭到土著印地安人的顽强抵抗。一个英军上尉根据他们驻北美总司令杰弗里·阿默斯特的命令，伪装友好，以天花病人用过的被子和手帕作为礼物赠送给印地安人首领，以示安抚，结果在印地安人中引起天花大流行而丧失战斗力，使英国侵略者不战而胜。
由于细菌武器如此“神威”，因而倍受侵略者的“偏爱”。他们不借代价，不择手段地从事细菌武器的研究。据记载，在近半个世纪中，至少有三个国家使用了细菌武器。
德国
在第一次世界大战期间，德国曾派间谍携带马鼻疽菌和炭疽菌培养物潜入协约国，将病菌秘密地投放到饲料中，或用毛刷接种到马、牛和羊的鼻腔里，使协约国从中东和拉丁美洲进口的3.45万头驮运武器装备的骡子感染瘟疫，影响了整个部队的战斗力。
日本
1935年，日本侵略者在我国哈尔滨附近的平房镇建立了一支3000人的细菌部队，这就是臭名昭著的731部队，专门从事细菌武器的研制。每月能生产鼠疫菌300公斤、霍乱菌1000公斤、炭疽菌500～600公斤，并用中国人们作活体试验，仅1940～1943年就使3000多人惨遭杀害。1940～1944年，日本帝国主义曾在我国浙江、湖南、河南、河北、山东和山西等省的11个县市多次使用细菌武器，结果在宁波和常德等地鼠疫大流行。在太平洋战争中，日本公然使用了当今世界上最缺德的生物武器——“性病武器”，这是世界战争史上闻所未闻的丑行。
美国
美国研制生物武器，是从1941年开始的。1943年在马里兰狄特里克堡建立了陆军生物研究所，从事生物武器的研制。根据美公开的记录报告透露：1971～1977年间美国每年用于生物战的经费都在1000万美元以上，并有专门生产细菌武器的研究所、实验场、工厂和仓库。朝鲜战争期间，美国先后使用生物(细菌)武器达3000多次，攻击目标主要是我国东北各铁路沿线的重要城镇如沈阳、长春、哈尔滨、齐齐哈尔、锦州、山海关、丹东等，以及朝鲜北部的一些主要城镇。