整个衙门外墙唯一的出入口就是位于中轴线正南方位的大门。这个大门也叫“头门”，它并不是一个简单的门洞，而是一座有屋顶的建筑物。这种屋宇式大门是中国建筑的一大特点，它的形制受到法律、礼制的严格限制，无论多大的州县，大门都只能是三开间(建筑物正面的开间，两根柱子之间的横向空间为一间)。每间各安两扇黑漆门扇，总共有六扇门，所以州县衙门也往往俗称“六扇门”。俗谚“衙门六扇开，有理无钱莫进来”，俗称衙门的差役、书吏之类的工作人员为“六扇门里的勾当”。
由来
古代衙门为显示威严、气派，多开六扇门。后遂以六扇门代指官府、衙门。
衙门以门为名，在这个建筑群里，各式各样的门户当然就具有头等重要的意义。不过最重要的是中轴线上的大门、仪门、宅门。
故宫的门也是六扇。
故宫每道门都是三个门，每个门两扇，共六扇。
为了突出大门的重要性，大门前面有照壁，两侧有“八字墙”，门口有的还放置一对呲牙咧嘴的石头狮子。也有的州县把门屋升高为两层或三层的门楼，兼为全城报时的鼓楼或谯楼。谯字原义同瞧字，有瞭望的意思。
传说
民间传说的“六扇门”则是指捕快之中一个特殊的旁支。这个“六扇门”通常只接手江湖帮派斗争和久为官府通缉的要犯，同时与各大门派有相当的交情，在朝廷和江湖中都有着举足轻重的权力，江湖中有身份的人犯案只要不上动天庭，都可以不了了之。
“六扇门”具有如此大的权力和能力，与统治者对“六扇门”的扶持和依赖有很大的关系。
唐贞观年间，朝廷初建六部。为彻底解决隋末农民起义的残余势力和各地绿林豪强，刑部建立“六扇门”秘密训练基地，训练新锐少年，名为“鹰犬”。
明朝万历年间，朝廷为了处理有关国家大事的案件，专门成立了一个集武林高手、密探、捕快和杀手于一体的秘密组织。因为这个组织的秘密性，又因为总部大殿是一个坐北朝南、东南西三面开门、每面两扇门总共六扇，所以叫做“六扇门”，组织成员因行动机密也叫总部为“六扇门”。因为这个组织行动诡异、手段凶狠、专办大案，民间广为传诵六扇门的威严恐怖。时间久了，六扇门在江湖上也就无人不知、无人不晓了。这个“六扇门”组织在查办魏忠贤的斗争中表现出色，但随着明朝灭亡也最终消失。
“六扇门”独特的社会地位和工作内容，形成了“六扇门”办案风格的神秘性。一方面，“六扇门”是朝廷之官，要接受正统的朝廷制度的约束;另一方面，“六扇门”又要直接和黑道的江湖人士打交道，必须要熟悉江湖规矩。正因为如此，“六扇门”的人进得衙门，出得江湖。他们遇到的事情千奇百怪，处理事情灵活多变;他们是衙门中的江湖人物，是江湖中的衙门掌门。他们代表衙门统管江湖一方，在江湖上拥有极大的权力，却也同时被不为朝廷效命的江湖豪杰所不齿。