1927年9月，南京国民政府同武汉国民政府合并，因南京简称“宁”，武汉简称“汉”，史称“宁汉合流”。“宁汉合流”的实质是中国国民党各个派系的暂时联合，他们的根本利益是一致的。宁汉合流后的政府，仍称南京国民政府。
相继叛变
蒋介石、汪精卫相继背叛革命后，中国国民党已变成为一个由代表地主、买办性的大资产阶级利益的反动集团所控制的政党。1927年7月以后，国民党内形成了宁、汉、沪3个集团.此外，还有粤、桂、晋等地方势力。宁、汉双方集中了国民党中最重要的一批领袖人物，又各自掌握着一个政府，拥有一支军队，割据着一大块地盘，因而成为最有分量的势力。他们为争夺最高权力明争暗斗，但很快地在反共的基础上开始合流。
1927年7月15日，汪精卫领导的武汉国民政府叛变革命，即“七一五”政变。
当蒋介石反革命气焰甚嚣尘上之时，投降与叛变的事件接踵而来。1927年5月17日，武汉国民政府所辖的第十四师师长夏斗寅叛变。21日，湖南许克祥叛变。这些事变使武汉国民政府内部汪精卫集团更加明目张胆进行反共活动。6月6日，汪精卫解除苏联最高顾问鲍罗廷在国民政府中的顾问职。同日，江西发生军阀朱培德叛变。19日，冯玉祥与蒋介石在徐州举行会议，达成反共、反苏、宁汉合作等协议。此时，两湖及江西的工农运动已遭严重摧残，湖北被杀害的农会会员4700余人，湖南被杀的农会会员达20000人。陈独秀却仍坚持机会主义立场，对蒋介石、汪精卫继续采取姑息迁就的态度。7月13日，中共中央被迫命令参加国民政府的共产党员退出政府，并发表对政局的宣言，斥责国民党的反共罪行，表示要“严厉的揭发一切假借孙中山先生旗号的伪国民党之出卖革命”。14日夜，汪精卫在武汉召开秘密会议，确定分共计划。15日召开分共会议，公布《统一本党政策案》，正式与共产党决裂，封闭武汉的工会、农会、疯狂屠杀共产党员和革命分子，提出“宁可枉杀一千，不可使一人漏网”的口号。
汪精卫集团的叛变，使中国革命遭受严重损失，第一次国共合作破裂，第一次国内革命战争终于失败，国民革命宣告彻底失败。
同流合污
他们为了实现“合作清党”、“统一党务”，进行了一系列酝酿和接触。冯玉祥从中牵线，与各方反复电商，于7月20日提出解决宁、汉合作的具体办法。汪精卫等表示愿意“和平统一”，同意“迁都南京”。蒋介石、李宗仁、胡汉民等欢迎武汉重要分子到南京“柄政”，赞成各方“共同北伐”。8月上旬，宁、汉双方基本上达成了妥协。这时，汪精卫等虽然同意与宁方合作，但仍坚持反蒋态度，且声浪 很大。同时，蒋介石排斥异己，引起桂系的不满，李宗仁、白崇禧等对蒋不再采取积极支持的态度。加之蒋介石亲自指挥的津浦线上战事的失败，使其陷入困境。蒋介石感到自己的地位还不巩固，便采取以退为进的策略，于8月13日发表下野宣言，宣布辞去国民革命军总司令职务，然后回浙江奉化。不久，东渡日本。蒋介石的下野，加快了宁、汉合作的步伐。9月11日至13日，宁、汉、沪3方代表在上海举行谈话会。出席会议的有汪精卫、谭延闿、孙科、李宗仁、张静江、蔡元培、李石曾、邹鲁、张继、谢持、许崇智等21人。宁方的蒋介石、吴稚晖、胡汉民和汉方的陈公博、顾孟余拒不出席。