相关统计
战后据统计，马尼拉围城期间，死亡的菲律宾人总数达10万人以上，平均每天有3000人遇害。考虑到美军攻城期间也动用了大量重武器，10万人中有一部分死于美日两军的交火。但大部分菲律宾人肯定是死于日军有组织的大屠杀。
对日军评价
从1932年的平顶山惨案到1945年的马尼拉惨案，日本所谓的“大东亚共荣圈”是以屠杀开始而以屠杀终结。奥斯维辛已经是终极的残暴，但日本“皇军”在亚洲的暴行时隔65年仍然在挑战着所有人承受力的极限。整个近代史上，找不到有哪一支军队这样广泛的制造和参与对平民的大屠杀。这是一支近代史上最暴虐、最野蛮、最反人类的军队，这是一个被宗教狂热式的天皇崇拜武装起来的披着文明外衣，却活在前现代的民族。我们诅咒这支军队，我们也同样警惕产生这样一支军队的民族和文明土壤，因为屠杀是他们的常态。
1945年2月，卷土重来的麦克阿瑟率美军直逼马尼拉城下。日本第14方面军司令山下奉文大将下令马尼拉为不设防城市，但海军部队拒绝服从。在美军强攻马尼拉期间发生了持续达一个月之久的屠杀事件，直到2月23日，美国军队重新夺回马尼拉。
美军缴获了一份这样的日军命令：“杀死菲律宾人时，尽量集中在一个地方，采用节省弹药和人力的方式进行，尸体的处理很麻烦，应把尸体塞进预定烧掉或炸毁的房屋里，或扔进河里。”