官方态度
日本驻菲律宾大使山崎隆一郎对日本在二战期间在菲律宾犯下的暴行表示忏悔，承认日军侵略对菲律宾人民带来的灾难是超出常人想像的。
1945年2月，在太平洋地区发起反攻的美军开始进攻马尼拉，在城内的日本军队作困兽斗，同时有计划地对当地平民进行屠杀，烧杀奸淫无恶不作，在3个星期内屠杀了10万平民，使一度被称做“东方明珠”的马尼拉变成到处是死尸的废墟。为纪念当年被日军杀害的无辜平民，当地一战争幸存者组织“纪念马尼拉1945年基金会”每年2月都要在马尼拉西班牙旧城举行悼念活动。
日本包装“日菲友好”
一位菲律宾学者向《国际先驱导报》指出，“菲律宾淡化日本侵略的历史有其独特的政治和经济背景。”1954年菲律宾就积极参与了美国主导成立的“东南亚条约组织”，与日本在政治上同属“西方阵营”。在美国的调停下，菲律宾在1956年7月与日本签署了和平条约以及战争赔偿协定。
2006年5月，日本驻菲律宾大使山崎隆一郎特地为一名日本移民增田女士追认了“女英雄”称号。增田女士1929年随父母移民到菲律宾，1941年日本占领菲律宾以后，增田被征召为日军翻译，她营救了许多菲律宾俘虏，演绎了日本版的“辛德勒名单”。日本官方则将她的事迹包装成为日菲友好的象征。
为纪念菲律宾日本和平协定签订50周年，两国政府宣布2006年为“菲日友好年”。2006年7月份在马尼拉举行的纪念仪式上，日本外相麻生太郎发表的演讲更是“可圈可点”。麻生以近乎轻描淡写的方式描述60年前的那场战争：“无论如何，就是在这片土地上上演了20世纪最悲惨的一幕，我的国家成为了你们的敌手。”接着，麻生话锋一转：“然而，也正是在这里，日本战后的主动受到了热忱的回应，宽恕了过去，如果不是忘记了过去的话。”
马尼拉的外交界人士认为，日本为了突破在亚洲外交的困局，刻意将菲律宾视为日本与周边曾经受到侵略国家关系发展的一个“典范”而悉心经营，并在相当程度上得到了十分需要日本经济援助的菲律宾政府的配合。马尼拉大屠杀-日军血腥罪行老照片
斥巨资收买人心
从经济的角度看，日本不仅是菲律宾最重要的贸易伙伴、投资国、旅游客源国，而且是最大的官方发展援助提供国。日本迄今向菲律宾提供了近100亿美元的援助资金。在首都马尼拉地区和菲律宾各主要城市，许多机场、公路、供电等基础设施都是用日元贷款建设。在这些设施上，都特意用菲律宾语、日语标有日本援建的醒目字样。
此外，据菲律宾官方估计，2006年9月菲律宾和日本签订的《经济伙伴协定》将可为菲律宾带来50亿至60亿美元的利益。日本在这个协定中还破天荒地部分开放劳务市场，允许菲律宾医护人员前往日本工作。对于贫穷的菲律宾人来说，到国外打工是摆脱贫困的唯一机会。
可以说，生活的困境和现实的经济利益使菲律宾人对“历史教科书”、“参拜靖国神社”乃至最新揭露出来的“菲版731”事件都抱有某种淡漠甚至淡忘的态度。