马尼拉大屠杀，也称马尼拉大惨案。1941年12月，美军撤出马尼拉后，宣布马尼拉为不设防城市，日军兵不血刃的侵占了马尼拉。1945年1月，美军从莱特湾出航，在林加延登陆吕宋岛，同时，美军第11空降师登陆纳苏格布，直指马尼拉。攻入城内的美军和日军展开了激烈的巷战。日军撤退过程中，对马尼拉进行了疯狂的破坏的屠杀，大约有四分之三的建筑被毁，125000多菲律宾人们遭到杀戮。
1941年12月8日，日本偷袭珍珠港之后，仅10个小时的时间，日军便对处于美国控制之下的菲律宾发起了猛攻。一个月之后，日本成功占领了马尼拉，大约有7万人沦为日军战俘。日军将这些战俘押解到100多公里之外的战俘营，全程境况惨烈，史称“巴丹死亡行军”。整个行军过程中仅在出发的时候给战俘吃了一个饭团，此后一路上不许战俘喝水进食，凡是企图找水和食物者，即被日军以刺刀或开枪处决。
一路上因饥渴而死或者遭到日军处死的战俘超过1万人，其中绝大多数是菲律宾人。抵达战俘营之后的两个月内，又有2.6万名战俘被日军虐待致死。
1945年2月，卷土重来的麦克阿瑟率美军直逼马尼拉城下。日本第14方面军司令山下奉文大将下令马尼拉为不设防城市，但海军部队拒绝服从。在美军强攻马尼拉期间发生了持续达一个月之久的屠杀事件，直到2月23日，美国军队重新夺回马尼拉。
战后据统计，马尼拉围城期间，死亡的菲律宾人总数达10万人以上，平均每天有3000人遇害。考虑到美军攻城期间也动用了大量重武器，10万人中有一部分死于美日两军的交火。
但大部分菲律宾人肯定是死于日军有组织的大屠杀。美军缴获了一份这样的日军命令：“杀死菲律宾人时，尽量集中在一个地方，采用节省弹药和人力的方式进行，尸体的处理很麻烦，应把尸体塞进预定烧掉或炸毁的房屋里，或扔进河里。”
战后远东军事法庭裁定，日军曾在圣保罗大学一次杀害994名菲律宾儿童。1945年2月4日至2月10日日军在巴石河南岸肆意奸淫屠杀，烧毁了教堂和图书馆，将避难所的3000名难民烧死，2月5日勒令城中男女分开排列街上，将男子用机关枪射杀，来不及杀害的无辜百姓则用手榴弹爆炸，尸横遍地。
此役日军战死者约12,000人、美军战死者约1,020人，战伤5,565人。平民百姓死伤约10万人至15万人之间，约为当时马尼拉人口数的百分之十。
战后成为菲律宾总统的艾尔皮迪欧·季里诺，妻子与五个儿女中的三个都在屠杀中遇害。日后在韩战期间，菲律宾政府对日本提出80亿美金的战争赔偿，遭到日本拒绝后，时任总统的季里诺立刻在一天之内将14名日本战犯处决。
这是一支近代史上最暴虐、最野蛮、最反人类的军队，这是一个被宗教狂热式的天皇崇拜武装起来的披着文明外衣，却活在前现代的民族。我们诅咒这支军队，我们也同样警惕产生这样一支军队的民族和文明土壤，因为屠杀是他们的常态。
然而近几年来日军曾经公布在马尼拉大屠杀中曾经对战俘有过解剖的行为，然而这样一则重磅消息却并没有在菲律宾引起任何的风波，于是很多人纷纷认为马尼拉大屠杀被遗忘了，那么马尼拉大屠杀被遗忘的原因是什么呢?
马尼拉大屠杀被遗忘是有特定的政治和经济原因的，早在很多年以前菲律宾就参加到东南亚条约组织中去，并且和日本同时站到了一条战线上，同时都属于西方的国家阵营。
在美国的有意引导之下，日本和菲律宾之间也签订了赔偿等条约。同时日本还将一名早期移民到菲律宾的日本人进行了赞扬，这位日本人曾经在屠杀事件中挽救了许多人，于是日本便将她包装为两国友好的见证。这是人们遗忘马尼拉大屠杀的政治方面的原因。