英国侵略埃及的英埃战争随之爆发。
1882年7月11日，英国分舰队炮轰亚历山大港。这支分舰队由8艘装甲舰、5艘炮舰和1艘驱逐舰组成，装备有69门大口径舰炮、88门中小口径舰炮和70门“米特拉约兹”炮，有舰员5700人。当时，亚历山大港的埃及守备部队有7500名训练较差的士兵，工事阵地简陋。经激烈交战，埃及伤亡2000人。英军2.5万人登陆，占领海港，并大肆洗劫。面对英军的侵略，祖国党立即发表告人民书，宣布“埃及民族和英国人之间进行着势不两立的战争”，允诺农民废除所欠外国人的债务。广大农民响应号召，踊跃参军，开罗等市举行反侵略示威游行。埃及军民在阿拉比的领导下，重点加强了开罗的北部阵线。1882年7月28日，埃及军队在道瓦尔村交战中使英军受挫。在接下来的三周内，埃军接连打退了敌人的数次进攻，使英军无法从北部进攻开罗。
但是，阿拉比等人犯了一个战略错误，只加强了开罗北部的防线，而对东线防御未给予应有的重视，这是因为他们轻信了西方国家会遵守苏伊士运河区中立的保证。
结果，英军把进军开罗的突破口定在苏伊士运河方面。8月，英军大量兵力在运河区登陆，20日占领运河区塞得港等要地，接着向开罗进犯，9月，在通往开罗的接近地泰勒凯比尔附近，双方进行了一场决战。埃及军民英勇抗敌，浴血奋战，坚守阵地达两个星期。英军改变策略，收买了游牧部落的封建贵族，特别是收买了参加抗战的贝都因族酋长。结果，英军于9月13日突破东部防线，埃及军队被迫退守开罗。
阿拉比力图利用正在泛滥的尼罗河天险抵御敌人，并决定发动开罗十万军民进行首都保卫战。
但是，开罗城内的官僚地主和部分军官动摇叛变，乘阿拉比指挥军民在城郊修筑防线之机，开门引敌入城。1882年9月15日首都陷落。阿拉比等爱国将领被俘，大量军民遭屠杀。英军攻陷开罗后迅速占领了整个埃及，战争以埃及的失败而告终。英埃战争的结束标志着埃及从半殖民地进一步沦为英国的殖民地。英国占领埃及后，担心法、俄效尤瓜分奥斯曼土耳其帝国其他领地，损害自己在中近东的殖民利益，于是一方面宣称对埃及的占领是“暂时的”，一旦秩序恢复，英军即行撤退;另一方面派遣其代理人以总领事的名义进行谈判。实际上，英国驻埃及总领事贝林是埃及的独裁者、英国殖民统治的代言人。他统治埃及25年(1883—1907年)，恣意摧毁埃及的民族工业，奖励外国主要是英国投资，推行单一作物种植制度，扩大棉花种植面积，使埃及成为英国棉纺织工业的原料产地。埃及的国民经济完全依附于国际资本主义，埃及成为英国商品输出和资本输出的场所。到第一次世界大战爆发后，英国正式宣布埃及为其保护国。英埃战争中埃及的失敌，原因是十分明显的。阿拉比虽然是陆军中校军官，但他代表软弱的埃及资产阶级，对英国侵略的危险不做任何准备。