创建
公元747年，阿巴斯的后裔阿布·阿巴斯利用波斯籍释奴艾卜·穆斯林在霍拉桑的力量，联合什叶派穆斯林，于公元750年(一说752年)推翻了倭马亚王朝统治，建立了阿巴斯王朝(750～1258年.)。阿巴斯王朝建立后，什叶派屡遭统治者镇压迫害，一部分人集体迁往北非。公元893年，也门什叶派伊斯玛仪派宣教师艾布·阿卜杜拉·侯赛因在麦加朝觐时接受北非柏柏尔人部落朝觐者邀请，并受伊斯玛仪派总部派遣，随这批朝觐者到达突尼斯，开始在基塔麦部落中传播伊斯玛仪派教义，宣称“马赫迪”即将复临人间，号召穆斯林起来摧毁现存秩序，建立公平正义的伊斯兰社会。艾布·阿卜杜拉·侯赛因在宣教过程中赢得众多信徒拥戴，遂趁机组建了一支武装力量，成为当地著名政教领袖。不久，伊斯玛仪派伊玛目赛义德·伊本·侯赛因为逃避哈里发迫害，乔装商人从叙利亚北部赛莱木叶伊斯玛仪派总部赴突尼斯同艾布·阿卜杜拉会合，但被艾格莱卜王朝的埃米尔齐亚达图拉二世捕获入狱。公元902年，艾布·阿卜杜拉率柏柏尔军发动起义，向艾格莱卜王朝各地军队发动猛烈进攻。
发展
公元909年3月，艾布·阿卜杜拉率柏柏尔军攻占首都拉卡达(今凯鲁万城)，推翻艾格莱卜王朝，将赛义德·伊本·侯赛因从狱中救出，并被拥戴其为哈里发。赛义德自称是先知穆罕默德女儿法蒂玛的子孙，什叶派第七代伊玛目伊斯玛仪的后裔，号称伊玛目乌拜杜拉·马赫迪，故立国名为法蒂玛王朝。初建都拉卡达，公元920年迁都马赫迪亚城(今凯鲁万东南海岸)。
赛义德(公元909～934在位)即位后，在政治上与巴格达的阿巴斯王朝相抗衡。在宗教上，奉什叶派伊斯玛仪派为国教，在聚礼日祈祷词中为阿里和哈里发祝福，遂成为伊斯玛仪派的宗教领袖。赛义德东征西战，对内镇压艾布·阿卜杜拉的反叛，对外将版图扩张至阿尔及利亚、摩洛哥、利比亚及西西里岛，为法蒂玛王朝奠定了基础。公元934年赛义德殁后，其继任者仍奉行向外扩张政策。
第四代哈里发穆仪兹(952～975在位)执政后期，派昭海尔·绥基利(JawharSiqilli?～992)率海陆军多次发动西征，公元967年肃清了科尔多瓦后伍麦叶王朝在马格里布的影响。公元968年，昭海尔率10万大军东征埃及。公元969年，昭海尔占领埃及伊赫什德王朝首都福斯塔特，遣其副将进占原属伊赫什德王朝的领土叙利亚、巴勒斯坦和希贾兹，随将之并入法蒂玛王朝版图。公元970～972年穆仪兹在弗斯塔特北郊营建新首都开罗。公元973年哈里发穆仪兹迁都于此。公元972年建筑最大的清真寺爱资哈尔大清真寺。其后吞并麦加和麦地那。王朝统治中心遂转到埃及。在第五代哈里发阿齐兹(公元975～996)统治时期，国势极盛，成为版图横跨亚非两大洲的强大伊斯兰国家，同巴格达的阿巴斯王朝和西班牙后伍麦叶王朝形成鼎足之势。
衰落
公元996年，阿齐兹去世，其子艾卜·阿里·曼苏尔·哈基姆(公元996—1021年)以十一岁继位。他在位期间杀大臣，毁圣陵教堂等基督教堂，歧视基督徒和犹太人。其后，哈基姆自称真主化身，一个新教派奉之，即为德鲁兹派，此派尚行于黎巴嫩。
公元1021年，哈基姆被暗杀，其子扎希尔继位(公元1021—1035年)年十六。与东罗马国王君士坦丁八世约，罗马国王许以东罗马境内各清真寺中提念哈里发名字，许重建君士坦丁堡清真寺，而哈里发许重建圣陵教堂。
公元1035年，麦阿德·穆斯坦绥尔(公元1035—1094年在位)以十一岁登基，其母为犹太人所卖犹太女奴，与该犹太人摄政。在位六十年，国势迅速衰落。公元1043年失叙利亚于塞尔柱土克曼人。北非西部、西西里岛亦失。所可道者，唯公元1058年，原巴格达将军白萨西里强迫阿巴斯王朝哈里发卡伊姆把职位的各种象征(包括先知的斗篷和别的遗物)转到开罗，各地穆斯林开始奉开罗哈里发为正宗。
11世纪后期，法蒂玛王朝开始衰落，大权落于亚美尼亚军人巴德尔·贾马里手中。公元1094年，穆斯坦绥尔死，巴德尔之子麦列克·艾弗德勒立其幼子穆斯台阿里。其后宫廷政变频繁，军人擅政，幼主频立，国家掌握的土地日趋缩小，财政收入窘迫。王朝军政大权落入大臣和马穆鲁克禁卫军军官手中。军队统帅控制国家大权，官制发展为世袭制，哈里发处于被保护的地位。各地总督割据，税收锐减，国库空虚。伊斯玛仪派内部分裂，波斯、伊拉克和中亚地区的伊斯玛仪派断绝与法蒂玛王朝的联系。突尼斯和阿尔及利亚相继脱离王朝控制。
公元1096～1144年间叙利亚和巴勒斯坦大部分属地先后被塞尔柱王朝和十字军占领。公元1071年，诺曼人占领西西里岛，并蚕食了非洲大陆一些土地。十字军入侵埃及后，西亚赞吉王朝苏丹努尔丁应法蒂玛王朝末代哈里发阿迪德之请，派部将希尔库及其侄子萨拉丁率军往援。公元1171年库尔德人萨拉丁推翻法蒂玛王朝哈里发阿迪德(公元1160～1171)，自立为苏丹，灭法蒂玛王朝，建立阿尤布王朝，从此在埃及恢复了伊斯兰教逊尼派地位。