归于大清
1635年起进入宗主制版图、1646进入清朝的主权版图、1705年起进入清朝的具体事务管理版图，等等，和硕特汗国主动纳入清朝，为多民族国家做出重大贡献。
独尊黄教
改变了西藏的诸教派地位关系，独尊格鲁派(黄教)。
和硕特汗国进入西藏之前，是噶举派的藏巴汗当政，后来快速推翻了一般区域的噶举派政权，但其它地方的噶举派政权没有被征服，形成独立局面。
噶举派不丹
不丹是噶举派当政，和硕特汗国时期打仗，但没征服该地的噶举派政权，后来才归附清朝。不丹后来因为内战受到西藏调停而勉强承认西藏是宗教意义上的宗主国，而政治上只视大清为宗主国，对格鲁派当政的西藏一般区域形成自主状态。
噶举派拉达克
和硕特汗国多次征战噶举派传统的拉达克，没有完全成功，因此拉达克长期独立(在藏巴汗时期拉达克就是小王国)，后来才成为藩属(异于阿里区域那种管理)，受驻藏大臣节制，而非管理(在西藏一般区域是管理)。拉达克地区孤单力薄，因此1834年被得到英国支持的锡克帝国侵占。后来，格鲁派在拉达克一些地方居领导地位，拉达克最大的寺庙提可色寺由噶举派寺庙变为格鲁派寺庙。
锡金是宁玛派当政，另一种情况。