布哈拉汗国为突厥人与伊朗人混合的军政教合一的军事封建王朝，受波斯影响较大，设有波斯式的中央集权官僚制度。汗国奉伊斯兰教逊尼派为国教，实行伊斯兰教法和部落习惯法相结合的司法制度。霍加家族、伊斯兰教长老在宗教和政治上享有较高的社会地位。苏菲派纳克什班迪耶教团和库布拉维耶教团受到汗国的尊崇，赐封有大量土地，建有豪华的麻扎。
布哈拉汗国将波斯文化、伊斯兰文化加以继承和发展，促进突厥—伊朗文化进一步丰富。撒马尔罕和布哈拉为中亚伊斯兰学术文化中心，汗国除对原有的清真寺、图书馆、天文台进行修葺扩建外，还新建有多所清真寺和伊斯兰教经学院，其中撒马尔罕的希尔达尔伊斯兰经学院为中亚地区的伊斯兰教育中心，培养了大批学者。苏菲派学者对《古兰经》和圣训作了注释和考证。此外，布哈拉汗国文学、史学盛极一时，建筑、绘画、书法等也达到较高的艺术水平，波斯细密画创作相当著名。
布哈拉汗国极盛时期有一支强大的军队，以骑兵为主力，构成中流砥柱，骑兵分为人马披铠甲的重装骑兵，与抛弃铠甲累赘的轻装骑兵。乌兹别克人与塔吉克人都是剽悍善战的骑士，他们弓马娴熟。中亚、西亚的武备以波斯工匠所锻造的最为精良，布哈拉王朝官营作坊多聘请波斯籍能工巧匠打造刀剑与甲胄，布哈拉战士多装备头巾盔、链板甲、锁甲、四镜甲等卫体防具，武器则有复合弓、斧、长矛、盾、大马士革刀、狼牙棒等。整体与萨法维帝国、奥斯曼帝国武备类似。