两江地区，指的就是今天安徽、江苏，江西，包括上海这四个地方。清朝时，两江地区极为富庶，当地交通便利，商贸发达，属于当时的经济中心。
两江地区每年都可以为朝廷提供巨额财政赋税，满足国库三分之一的需求。每次科举榜上一半的人才，基本都来自这个地区。
所以，这也带来一个问题，如何才能管理好两江地区。对于清朝皇帝而言，这是一个头疼的难题。因为当时仍然是时局不稳，选择反抗的，依然大有人在。
尤其是江南地区，在明、清改朝换代，反抗得最为激烈。如果处理不好，对于刚刚建立的基业，可能会产生巨大的冲击。
清朝除了驻扎重兵外，也开始借鉴明朝管理地方的一些制度，在两江制度推行。明朝的督抚制度被运用上来。当然，这个也经历很长时间的摸索。
因为明朝的督抚制度，本身也不完善，再加上形势的变化。直到康熙二十一年，两江总督的辖区、职权、跟当地巡抚的关系，才被逐步确立下来。
总督也由过去的地方军事掌管，转变为地方军政掌管。这个确立的时间，跟其他地方总督相比，要稍微早一些。直隶总督到雍正二年才逐渐确立下来。
陕甘总督到乾隆二十五年才成为定制，中间经过多次变动。所以，两江总督的定制，实际上为清朝其他总督的设立，提供了很好的样式。
跟其他地方总督一样，两江总督自然总督所拥有的基本职权。它可以给皇帝单独上奏折，请示一些重要事务，或者给皇帝问好之类。
皇帝会进行回批，等到君臣二人商议后，即可推行相关事务。有时这些事务皇帝也会跟其他大臣商议，走公开程序，下发给总督施行。
朝廷给总督这一职权，即是为了方便总督处理事务，更是为了防止总督、巡抚之间，互相抱团。所以，朝廷也会给巡抚单独上奏折的职权。他们如果发现，对方有什么不对劲的地方，可以跟朝廷举报。
为了防止两个人私下达成默契，清朝在总督、巡抚的职权，刻意做了很多交叉。不过，总督职权上，会更偏向军事，巡抚更侧重民政。当然，这个并不是说，总督不管民政。
它也要负责，教化百姓，鼓励教育、引导风俗等事务。所以，总督跟巡抚之间，属于互相交织，互相监督的关系。除此之外，朝廷通常会让两江总督兼任兵部尚书、都察院右都御史两个职位。
兵部尚书负责全国军事，兼任这一职位后，两江总督可以对辖区军队更好调动，直接节制辖区内绿营军。如果某一省份起战事，两江总督可以不用上奏，直接调集三个省份的兵力参战。
这个兵部尚书只是兼任虚衔，不具备实权。都察院右都御史是专门监察官员，两江总督可以凭着这个兼职，拥有监督任免辖区内文武官员的职权。
一些特殊情况下，两江总督会被授予大学士兼职。位居正一品。这让它可以从中枢朝廷，站在全国范围调度考虑。不过，这个兼职比较少。
当然，两江地区的特殊情况，也会给两江总督的职权带来不同。作为一个富裕地区的总督，两江总督的养廉银，也是位居全国总督前列。而且，随着形势变化，朝廷给两江总督的兼职，也越来越多。
清朝中期时，两江地区的漕运、盐政、河道三项事务，就开始逐渐交给两江总督担任。这三项事务，清朝都曾专门设立级别颇高的官员担任。可见地位重要。
漕运是把地方粮食，通过水路，运往京城、或指定地区的办的一种办法。两江地区因为产量丰富，成为漕粮的主要提供地点。
两江总督要协助漕运总督，完成漕粮的征收、运输，并有直接监察的职权。如果漕运总督出现空缺，两江总督也可兼任。
盐政是过去朝廷的主要收入来源。清朝清朝盐政中，两江地区最为重要。但是，但是，盐政内部腐败也是最严重的。
因为辖区原因，朝廷经常会让两江总督整顿盐务，到了道光十年的时候，直接裁撤两淮盐政，由两江总督兼任。
河道事务，两江总督辖区内，主要是对漕运经过的河流，进行整治。清朝走漕运的河流，基本在黄河、淮河、运河流域。这些河流在清朝时，都有经过两江地区。所以，两江总督也负责河道事务。
乾隆中期时，开始兼任河道事务。不过，在咸丰十年，黄河改道山东，两江地区内的河道事务，就不再重要。当时驻守在江苏境内的江南河道总督，被一并裁撤。两江总督的河道事务，就逐渐减轻了。
但是，除了漕运、盐政、河道三项兼职，到晚清时，两江总督还获得南洋大臣的兼任。这个职位的重要性，让两江总督一下子拥有掌握外交，筹办海防、稽查关税、手握南洋海军、陆军、创办洋务企业的职权。
晚清多项洋务举措，都跟这一职位有关。两江总督也一跃成为仅次于直隶总督后，清朝最有地位的总督。