清朝
清军取胜的成功之处：一是出兵迅速，攻其不备。噶尔丹自乌兰木通战败，自知不敌清军。于是，再度兴兵叛乱时，只在漠北掳民占地，不复南下。自恃有大漠这道天然屏障，清军对他也无可奈何。针对噶尔丹的自负心理，康熙帝决定亲率三路大军征伐。噶尔丹没想到清军真的会长途跋涉越过大漠来攻，更没想到康熙帝会率军亲征，思想和物质上都没有做好准备，只得仓皇而逃，出征收到了出其不意的效果。
二是巧妙部署，出奇制胜。康熙帝知叛军士兵多来自草原部落，能征惯战，有一定战斗力;而且机动速度快，很难围歼。为此，制定出3路大军进行围剿的计划。当东、西两路清军未能及时赶到，中路清军首先近敌时，康熙帝又以兵分
两路夹击的部署吓退叛军。同时命西路军火速赶到叛军西逃必经之地昭莫多，利用山势和密林巧布伏兵，终于一举歼敌。
三是后勤保障充分。中路清军为越过大漠，由数千辆大车组成了庞大的后勤运输部队。这支部队组织严密，又有专门的军队保卫，而且备有大量的铺路材料，因而能顺利地通过数百里大沙漠，较好地保障中路清军所需粮秣，同时为西路清军提供支援。这对于长途远征消灭噶尔丹叛军，起了非常重要的作用。
准噶尔
噶尔丹军的主要失误：一是过于自信，战备不足。噶尔丹自以为有数百里大漠的天险可依，清朝大军难于通过，康熙不会冒险出征，因此，没有进行任何作战准备。当清军突然出现在附近时，只能选择逃跑这条出路。二是审势不够，贸然追击，以致中伏被歼。噶尔丹摆脱中路清军追击后，又遇到西路清军400骑兵，未作详尽侦察和分析，即认为这不过是少量偏师，不堪一击，于是穷追不舍，结果误入清军伏击圈。三是家眷和辎重携带过多，行动不便，且容易遭受攻击。昭莫多之战就是由于后军首先溃乱导致全军失利的。