保存至今的阿蒙霍特普四世统治时期的埃及艺术作品(壁画和雕塑)大多属于阿马尔奈风格，它们大量描绘了法老的家庭生活，而其中他的家庭成员尤其是涅弗尔提提王后的形象显得非常突出。阿马尔奈风格的艺术品多是描绘法老与王后的幸福生活为主题。这些艺术品描绘的涅弗尔提提的形象出现了美丑两个极端，有时会夸张地表现在她的拉长的头部和突出的腹部。这是埃及历史上唯一一次法老的神圣家庭被以自然主义的风格表现出来，并且他的家庭明显显示出其乐融融的特点。涅弗尔提提经常作出一些只有法老本人才会做的举动，这可能暗示她获得了超过一个王后通常所应拥有的权力。
保存下来的埃赫那顿的艺术形象表现出他有一副非常奇特的外貌：极其细长的四肢，突出的腹部和宽大的臀部。这带来了一些奇怪的观点，例如认为埃赫那顿实际上是一个化装成男人的女人，或是双性人，或者患有什么性别决定混乱的病症。这些猜测很少有什么实际依据。另一种理论解释说法老奇怪的容貌是受到马凡综合症的折磨的缘故。
直到埃赫那顿的木乃伊被发现并确定身份之前，有关他的种种身体缺陷的解释还会不断出现。然而，必须注意到，作为一个法老，埃赫那顿完全可以控制工匠将自己及整个王室家庭的形象塑造成什么样子。与其说现存的雕刻展示了法老本人的真实容貌，更容易相信今天看到的奇怪形象可能正是埃赫那顿特意要艺术家和工匠所描绘的风格。
由于阿蒙霍特普四世的宗教改革在古埃及历史上的特殊地位，以及其一神教的独特性质，引起了许多研究者对这位法老的精神状态和相关历史事实的强烈兴趣。特别是，阿顿信仰是已知的世界上第一种一神教，这无疑刺激了许多人去寻找它与后来出现于中东的几种一神教——犹太教、基督教和伊斯兰教的关系。他们提出了许多有趣的理论，然而这些理论很少有什么说服力。
最有意思的理论之一来自于精神分析学派的创始人、奥地利心理学家弗洛伊德。弗洛伊德根据摩西的名字与埃及许多法老名字中“摩斯”音节相近这一点，得出了非常惊人的结论：摩西是埃及人，而且与阿蒙霍特普四世存在某种关系。实际上，“摩斯”在古埃及语里有“儿子”之意，往往跟在某位神灵的名字后面构成人名(如图特摩斯)。弗洛伊德推断，保存在旧约中的摩西的名字是不完整的，其原始形式很可能是“阿顿摩斯”。因为摩西是严格的一神教犹太教的创始人，而他在埃及唯一可能接触到的一神教就是阿蒙霍特普四世推行的阿顿信仰。弗洛伊德继续推测，摩西可能是忠于阿蒙霍特普四世的新宗教的官员，甚至可能是法老的儿子!无论如何，后来在阿马尔奈所出土的铭文当中的《阿顿颂词》，发现这段颂扬唯一真神“阿顿”的内容与描述方式，与流传至今的诗篇第104节十分相近。这引起许多学者将阿蒙霍特普四世的宗教与早期犹太教的联系，作出许多可能的假设。