战争经过
日军计划
1944年12月美军占领莱特岛后，盟军西南太平洋战区总司令道格拉斯·麦克阿瑟命令第6集团军和第8集团军一部共28万人在吕宋岛登陆，歼灭驻菲律宾日军主力。日军在吕宋岛驻有陆、海军28.7万人，由第14方面军司令山下奉文上将统一指挥;吕宋岛的日军既没有能够摧毁美军坦克的武器，又没有飞机，因而不指望决战，决心以持久防御牵制和消耗美军，计划以一个师在林加延湾沿岸组织防御，以方面军主力15万人编成尚武集团，防守北吕宋地区;以第1挺进集团等部3万人编成建武集团守卫中吕宋克拉克以西地区;以第8师等部10万人编成振武集团，扼守南吕宋马尼拉以东地区。
美军登陆
根据计划，登陆行动将在1945年1月9日展开，代号为S日，日军报告超过70艘盟军舰艇集结在仁牙因湾。美第6集团军，辖第1、第14军，约20万人在作战舰艇233艘、运输船只800艘和飞机1000架支援下，在吕宋岛西岸林加延湾登陆。登陆前的炮火准备在早上7时开始，一小时后，登陆行动正式展开，登陆部队遭到日军神风特攻队的顽强抵抗，奥曼尼湾号护航航空母舰被一架神风特攻飞机击毁，同时一艘驱逐舰及数艘其它军舰被击沉，第3舰队的舰载机对登陆部队提供密接空中支援，猛烈炮轰及轰炸日军大炮据点。
在仁牙因湾登陆的部队是由沃尔特·克鲁格陆军中将指挥的美国第6军团，数天内第6军团大约175,000名士兵在沿20公里的海滩登陆，美国第1军负责掩护其侧翼，而由奥斯卡·格利斯沃德率领的美国第14军则向南进攻马尼拉，虽然克鲁格十分担心日军攻击他毫无掩护的东翼，但日军没有这样做，克拉克山区的建武集团因缺乏御防准备，很快便被赶进深山。而美军直到一月23日到达克拉克空军基地前没有遇到强大的抵抗，攻取基地的战役直至1月底，攻占该基地后，第14军继续向马尼拉推进。
为攻占马尼拉，1945年1月31日，美军第11空降师的两个团实施空降行动，攻占一座桥梁及之后向马尼拉前进，为尽快攻占马尼拉，美国第8集团军第11军和第11空降师分别在苏比克湾西北和马尼拉湾以南两个地段登陆，对马尼拉形成夹击态势。
争夺首都
对第14方面军来说，如何对待首都马尼拉，是吕宋岛防御上的一个问题。其一般方针是，不在马尼拉设战场，部队撤离市区，军需物资送往各据点。但海军和航空部队坚持死守马尼拉，因而在执行中不够坚决彻底。2月3日，美军第11空降师的伞兵奇袭马尼拉市，在这个拥有70万人口的菲律宾首都同日军展开了长达4个星期的激烈巷战。日军守卫马尼拉的海军部队凭借市中心坚固的建筑物进行抵抗，但美军用猛烈的炮火摧毁了一座座建筑。3月3目，麦克阿瑟宣告马尼拉彻底解放，这场战斗使马尼拉市中心成为一片废墟。
山区战斗
岛上日军第14方面军司令山下奉文陆军大将已命令其部队当美军进入市内时破坏所有桥梁及其基础设施，又挖掘壕沟以阻止美军前进，麦克阿瑟在同一天宣布即将收复马尼拉，2月11日，第11空降师攻占日军在外围最后一个据点，因此包围整座城市，美军及菲律宾军在随后数星期在市内进行扫荡行动。3月3日，美军占领马尼拉，随后向吕宋岛西南和东南部进攻。
尚武集团把富饶的稻米产地卡加延河谷作为根据地，以碧瑶以西至圣何塞以北一带山地作为南面的屏障，自西向东依次部署了第19师、第58独立混成旅、第23师、第2坦克师以及第10师等部队，以抵御美第1军(美军5个师、美菲军1个师)的猛烈攻击，特别是在巴列特，撒拉克撒克山垭口展开了激战，美军用推土机在险峻的山地中开辟道路，向前推进坦克和重型火炮，以压倒之势攻击日军。4月下旬，碧瑶失守。6月，美军进入卡加延河谷，6月下旬完全打通了阿帕里至碧瑶和阿帕里至圣何塞的两条道路。此后，日军被撵入深山，在饥饿和疾病的折磨下进行持久战。指挥马尼拉海军防卫部队的振武集团在救援作战中失败，又于2月底受到美第14军的攻击，被追陆续退入山中。这支部队5月1日起改称第41集团军，但到6月底已经丧失了有组织作战能力。但仍坚持抵抗，余部直至日本投降后才放下武器。此役，美军损失4.7万人、舰艇17艘;日军亡21万人。(日本投降时山下奉文直辖的尚武集团15.2万人，剩下5.5万，横山静雄的振武集团10.5万人，剩下1.25万人。冢田理喜智中将的建武集团3万人剩下1300人)。